More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0951 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0951  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 
361 aa  751    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1508  radical SAM enzyme, Cfr family  59.66 
 
 
359 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.868502  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1539  radical SAM protein  54.44 
 
 
363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.177286  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1414  radical SAM enzyme, Cfr family  55.81 
 
 
361 aa  393  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0825  hypothetical protein  54.65 
 
 
366 aa  384  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1166  radical SAM enzyme, Cfr family  54.15 
 
 
359 aa  364  1e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.565735 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1427  radical SAM enzyme, Cfr family  50.14 
 
 
362 aa  352  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  41.79 
 
 
348 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2243  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.94 
 
 
359 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.726084 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1782  radical SAM protein  41.31 
 
 
349 aa  256  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4731  radical SAM enzyme, Cfr family  39.83 
 
 
350 aa  255  8e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698724  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3089  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.53 
 
 
360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.929572  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.16 
 
 
340 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3124  hypothetical protein  41.57 
 
 
365 aa  251  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.39 
 
 
373 aa  250  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106958  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3008  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.39 
 
 
373 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00899057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3151  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.83 
 
 
373 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00905599  hitchhiker  0.00812914 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.27 
 
 
373 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.563776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1370  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.83 
 
 
373 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1226  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.55 
 
 
373 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173043  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3315  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.55 
 
 
373 aa  247  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1225  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.55 
 
 
373 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.461537  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1296  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.55 
 
 
373 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499019  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3855  radical SAM enzyme, Cfr family  41.74 
 
 
348 aa  247  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.74079  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2311  radical SAM protein  41.95 
 
 
371 aa  246  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.27 
 
 
373 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1287  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.11 
 
 
373 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  41.21 
 
 
377 aa  245  8e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.83 
 
 
373 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0888845  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1431  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.78 
 
 
367 aa  245  9e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1429  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.27 
 
 
373 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0876618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2967  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.18 
 
 
358 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0788473  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.42 
 
 
364 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  38.67 
 
 
376 aa  242  6e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1541  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.27 
 
 
373 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.865101  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  40.83 
 
 
364 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.77 
 
 
343 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07736  hypothetical protein  38.18 
 
 
346 aa  241  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.83 
 
 
348 aa  241  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1113  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.83 
 
 
373 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.686108  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1253  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.99 
 
 
373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.405878  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  39.66 
 
 
382 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.77 
 
 
343 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3129  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.6 
 
 
380 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  39.43 
 
 
382 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0483  radical SAM enzyme, Cfr family  39.2 
 
 
350 aa  238  9e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0926837  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  39.88 
 
 
367 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  38.57 
 
 
344 aa  238  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3115  radical SAM enzyme, Cfr family  39.02 
 
 
353 aa  238  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.248396  hitchhiker  0.0000000842526 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1336  radical SAM family enzyme  38.86 
 
 
370 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  39.32 
 
 
392 aa  238  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1397  radical SAM protein  38.86 
 
 
370 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.724249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4986  radical SAM enzyme, Cfr family  39.38 
 
 
349 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.323052  hitchhiker  0.00454129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  38.07 
 
 
379 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  40.28 
 
 
366 aa  237  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  39.72 
 
 
382 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0620  hypothetical protein  37.39 
 
 
370 aa  236  3e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180215  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2611  hypothetical protein  38.66 
 
 
382 aa  235  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00319585  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.44 
 
 
347 aa  236  7e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  38.64 
 
 
382 aa  235  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  38.07 
 
 
378 aa  235  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  38.64 
 
 
382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  38.64 
 
 
382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.15 
 
 
347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  38.86 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  38.86 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0445  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.62 
 
 
386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  38.86 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000355307 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  38.7 
 
 
375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  38.81 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.02 
 
 
351 aa  233  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  39.08 
 
 
362 aa  233  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  38.1 
 
 
357 aa  233  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  38.57 
 
 
381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  40.06 
 
 
359 aa  233  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  39.76 
 
 
349 aa  232  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3329  hypothetical protein  40.68 
 
 
428 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1581  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.62 
 
 
343 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000011547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1204  radical SAM enzyme, Cfr family  40.06 
 
 
347 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110623 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  40.28 
 
 
365 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.39 
 
 
346 aa  230  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2012  radical SAM enzyme, Cfr family  35.82 
 
 
357 aa  230  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3393  radical SAM enzyme, Cfr family  38.02 
 
 
382 aa  229  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1292  radical SAM protein  38.24 
 
 
402 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206153  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  39.09 
 
 
384 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  36.13 
 
 
372 aa  229  7e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2558  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.48 
 
 
351 aa  229  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.150479999999999e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.19 
 
 
351 aa  229  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  39.36 
 
 
356 aa  228  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  38.24 
 
 
384 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0596  radical SAM enzyme, Cfr family  36.78 
 
 
353 aa  228  1e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  37.64 
 
 
371 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000160208 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1388  radical SAM enzyme, Cfr family  40.41 
 
 
462 aa  227  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40320  hypothetical protein  36.93 
 
 
381 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  40 
 
 
345 aa  227  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.36 
 
 
372 aa  227  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1905  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.4 
 
 
347 aa  226  4e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0212666  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.2 
 
 
361 aa  226  5.0000000000000005e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  35.85 
 
 
388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  39.43 
 
 
364 aa  225  8e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>