More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2928 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  100 
 
 		 345 aa  719    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  76.36 
 
 		 355 aa  544  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  72.07 
 
 		 356 aa  530  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  69.68 
 
 		 355 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  71.43 
 
 		 340 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  71.13 
 
 		 340 aa  508  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  67.46 
 
 		 367 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  64.12 
 
 		 361 aa  464  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  60.24 
 
 		 351 aa  413  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.57 
 
 		 351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164087  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16031  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.45 
 
 		 356 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.38 
 
 		 356 aa  391  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18821  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.13 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1012  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.82 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12087  predicted protein  55.28 
 
 		 340 aa  363  3e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16851  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.26 
 
 		 348 aa  339  5e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.38 
 
 		 347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16611  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  48.08 
 
 		 348 aa  332  5e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.785393  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1574  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.2 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  43.15 
 
 		 349 aa  295  7e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49687  predicted protein  42.9 
 
 		 369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.622489 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  43.36 
 
 		 344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  43.07 
 
 		 349 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1533  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.43 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.48 
 
 		 362 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.52 
 
 		 362 aa  279  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.52 
 
 		 362 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.52 
 
 		 362 aa  279  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.52 
 
 		 362 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.52 
 
 		 362 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.52 
 
 		 362 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  43.49 
 
 		 348 aa  278  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.6 
 
 		 347 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.84 
 
 		 347 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.26 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.5 
 
 		 362 aa  276  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.35 
 
 		 362 aa  276  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.94 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.18 
 
 		 349 aa  276  5e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  42.9 
 
 		 377 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  40.59 
 
 		 369 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.04 
 
 		 342 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3115  radical SAM enzyme, Cfr family  42.42 
 
 		 353 aa  269  5e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.248396  hitchhiker  0.0000000842526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.57 
 
 		 365 aa  268  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  46.1 
 
 		 318 aa  268  8e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  42.47 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  41.74 
 
 		 356 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.99 
 
 		 364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  40.11 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.67 
 
 		 364 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.67 
 
 		 364 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2243  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.12 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.726084 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  41.45 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  41.46 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1660  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.17 
 
 		 389 aa  262  6e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  41.67 
 
 		 357 aa  262  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  42 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  43.11 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.61 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  43.11 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.37 
 
 		 348 aa  259  4e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0458  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.55 
 
 		 368 aa  259  6e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.65 
 
 		 343 aa  258  8e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0445  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.41 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1882  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.64 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.461219  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0620  hypothetical protein  39.71 
 
 		 370 aa  258  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180215  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2087  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.64 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.122222  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1431  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.91 
 
 		 367 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  39.41 
 
 		 381 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  40.54 
 
 		 408 aa  257  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  39.41 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  40.59 
 
 		 372 aa  256  4e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  39.41 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  39.41 
 
 		 381 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000355307 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.36 
 
 		 340 aa  256  5e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0007  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.64 
 
 		 356 aa  255  7e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0937459  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  42.44 
 
 		 384 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14130  radical SAM enzyme, Cfr family  40.12 
 
 		 351 aa  255  8e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1602  radical SAM enzyme, Cfr family  43.66 
 
 		 363 aa  255  9e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.113295 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  41.52 
 
 		 382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  42.49 
 
 		 342 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.36 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1930  radical SAM enzyme, Cfr family  43.66 
 
 		 362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1816  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.69 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.58 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  40.46 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  41.81 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  39.77 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  39.12 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  42.31 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  38.78 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  39.76 
 
 		 350 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  38.78 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  41.52 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  41.64 
 
 		 357 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.29 
 
 		 351 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  38.82 
 
 		 378 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1148  radical SAM enzyme, Cfr family  40.12 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  0.550837 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1743  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.54 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.499617  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3393  radical SAM enzyme, Cfr family  37.91 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>