More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0007 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1882  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  97.47 
 
 
356 aa  716    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.461219  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0007  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 
356 aa  729    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0937459  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2087  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  98.6 
 
 
356 aa  720    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.122222  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0021  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  83.15 
 
 
356 aa  618  1e-176  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  72.05 
 
 
381 aa  527  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1816  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  71.06 
 
 
354 aa  525  1e-148  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  70.77 
 
 
371 aa  518  1e-146  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1743  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  70.61 
 
 
358 aa  501  1e-141  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.499617  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0059  radical SAM enzyme, Cfr family  65.14 
 
 
358 aa  481  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.955574  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2093  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  59.26 
 
 
356 aa  437  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  44.73 
 
 
342 aa  309  5.9999999999999995e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1581  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.05 
 
 
343 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000011547  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.35 
 
 
360 aa  299  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.06 
 
 
346 aa  296  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  46.55 
 
 
349 aa  296  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.4 
 
 
351 aa  293  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2022  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.14 
 
 
371 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2558  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.65 
 
 
351 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.150479999999999e-35 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.49 
 
 
364 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.19 
 
 
364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1431  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.58 
 
 
367 aa  286  5e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2311  radical SAM protein  44.78 
 
 
371 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0445  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.67 
 
 
386 aa  285  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.32 
 
 
347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.55 
 
 
365 aa  281  9e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.11 
 
 
351 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.69 
 
 
362 aa  280  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.69 
 
 
362 aa  279  5e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.69 
 
 
362 aa  279  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.69 
 
 
362 aa  279  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.69 
 
 
362 aa  279  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.2 
 
 
362 aa  279  5e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.69 
 
 
362 aa  279  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.69 
 
 
362 aa  279  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4182  radical SAM protein  41.57 
 
 
374 aa  279  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.11 
 
 
362 aa  279  6e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.69 
 
 
362 aa  279  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.69 
 
 
362 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2967  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.2 
 
 
358 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0788473  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2243  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.29 
 
 
359 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.726084 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  41.14 
 
 
369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  42.32 
 
 
344 aa  273  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1567  hypothetical protein  43.57 
 
 
346 aa  273  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00430195  hitchhiker  0.00703244 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.62 
 
 
364 aa  272  5.000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.97 
 
 
364 aa  272  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.97 
 
 
364 aa  272  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2505  radical SAM protein  42.6 
 
 
391 aa  272  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282858  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2806  hypothetical protein  43.48 
 
 
427 aa  272  8.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0241  putative pyruvate formate lyase activating enzyme 2 (yfgB)  43.77 
 
 
403 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.283575  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0648  hypothetical protein  40.87 
 
 
413 aa  271  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  42.36 
 
 
376 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0028  radical SAM protein  41.38 
 
 
396 aa  271  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  41.76 
 
 
375 aa  268  8e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0679  hypothetical protein  40.33 
 
 
409 aa  268  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  41.07 
 
 
364 aa  268  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  43.43 
 
 
371 aa  268  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3626  hypothetical protein  43.48 
 
 
397 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  40.55 
 
 
342 aa  266  4e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0041  radical SAM protein  41.04 
 
 
392 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3311  radical SAM enzyme  42.36 
 
 
406 aa  265  7e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.853243  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  40.12 
 
 
378 aa  264  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1905  radical SAM protein  40.27 
 
 
403 aa  265  1e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3089  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.89 
 
 
360 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.929572  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0090  radical SAM protein  42.61 
 
 
411 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0076  hypothetical protein  42.33 
 
 
411 aa  263  3e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  40.53 
 
 
359 aa  263  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3329  hypothetical protein  40.11 
 
 
428 aa  263  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0035  hypothetical protein  41.4 
 
 
399 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2859  radical SAM protein  41.09 
 
 
408 aa  263  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1380  radical SAM protein  42.27 
 
 
399 aa  263  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  40.34 
 
 
382 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.92 
 
 
344 aa  263  4.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  40.86 
 
 
383 aa  262  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0401  radical SAM enzyme, Cfr family  41.4 
 
 
399 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.213699  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0085  radical SAM enzyme, Cfr family  40.06 
 
 
404 aa  262  8e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1382  radical SAM superfamily protein  40.46 
 
 
392 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0050  radical SAM protein  40.46 
 
 
392 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.890909  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.62 
 
 
354 aa  261  1e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.428537  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  40.27 
 
 
366 aa  261  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1922  radical SAM enzyme, Cfr family  40.97 
 
 
425 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056484 
 
 
-
 
NC_004310  BR0077  hypothetical protein  42.05 
 
 
411 aa  261  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0709  hypothetical protein  40.52 
 
 
398 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  41.96 
 
 
357 aa  260  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1148  radical SAM enzyme, Cfr family  40.05 
 
 
383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  0.550837 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1640  radical SAM protein  40.69 
 
 
425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  0.136917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  38.48 
 
 
373 aa  259  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  39.94 
 
 
372 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1056  radical SAM enzyme, Cfr family  40.05 
 
 
383 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0486076  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0426  radical SAM enzyme, Cfr family  41.14 
 
 
359 aa  258  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  39.59 
 
 
372 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2966  radical SAM enzyme, Cfr family  40.73 
 
 
399 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.80573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3068  radical SAM protein  40.8 
 
 
413 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0093  hypothetical protein  40.52 
 
 
399 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82991  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2611  hypothetical protein  39.39 
 
 
382 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00319585  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  39.3 
 
 
372 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  39.39 
 
 
382 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0269  hypothetical protein  40.35 
 
 
410 aa  256  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  39.19 
 
 
397 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1592  radical SAM enzyme, Cfr family  40.69 
 
 
425 aa  256  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4986  radical SAM enzyme, Cfr family  41.95 
 
 
349 aa  256  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.323052  hitchhiker  0.00454129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>