More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0853 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 332 aa  688    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  61.49 
 
 		 331 aa  420  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  44.51 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  44.12 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  38.26 
 
 		 311 aa  229  7e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  30.3 
 
 		 340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  29.06 
 
 		 397 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  29.59 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 343 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  29.04 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 367 aa  89.4  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 355 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 351 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  29.65 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.65 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.65 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  22.92 
 
 		 515 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 		 471 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  31.72 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  27.22 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  23.65 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  28.49 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 		 565 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 474 aa  72  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  30.6 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0480  Radical SAM domain protein  22.88 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00535769  hitchhiker  0.00252735 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  27.89 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  23.96 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  30 
 
 		 447 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  23.6 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.71 
 
 		 323 aa  67  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.37 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.68 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  24.26 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0848  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.26 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  32.04 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  27 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.83 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  25.53 
 
 		 778 aa  61.2  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.6 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.57 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  35.43 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.65 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.21 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  25.86 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0304  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.57 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2268  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.5 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  22.08 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20010  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.08 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0117672 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.63 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  28.87 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  24.71 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  21.93 
 
 		 445 aa  59.7  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 404 aa  59.3  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5988  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.82 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  24.55 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.77 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1648  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.61 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  32.64 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0904  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.13 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0102552  normal  0.0824176 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.63 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1151  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.67 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00861011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  31.62 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.46 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  23.45 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.81 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  31.78 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0087  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.52 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0823878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  30.83 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1400  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.42 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4120  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.29 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  26.54 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.59 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4250  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>