135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0369 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 317 aa  658    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2787  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  24.33 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0197  radical SAM family protein  21.71 
 
 		 367 aa  82.4  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  25.09 
 
 		 355 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  22.3 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  23.95 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  23 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  23.93 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  23.67 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1838  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 491 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  34.39 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1943  Radical SAM domain protein  33.08 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227047  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 335 aa  67  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  26.3 
 
 		 356 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  21.54 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  26.87 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3973  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  26.53 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  26.53 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  26.53 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  26.53 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  26.53 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  24.16 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  23.31 
 
 		 873 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  27.09 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  26.19 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0795  Radical SAM domain protein  25.73 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.62 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  21.17 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  22.48 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  23.61 
 
 		 574 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  21.15 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  19.52 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1849  Radical SAM domain protein  24.25 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5367  hypothetical protein  26.06 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0445867  hitchhiker  0.0000016486 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  21.19 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  21.4 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  36.11 
 
 		 392 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1692  radical SAM family protein  22.9 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  27.22 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 		 343 aa  53.1  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 		 445 aa  52.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  28.65 
 
 		 401 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 401 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 401 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  23.39 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  27.36 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  20.58 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  21.95 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  23.26 
 
 		 515 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 471 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 		 437 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  30.07 
 
 		 513 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0416  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.85 
 
 		 341 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 		 474 aa  49.7  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1043  radical SAM domain-containing protein  21.71 
 
 		 297 aa  49.3  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.22 
 
 		 348 aa  49.3  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 450 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.97 
 
 		 375 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0188  radical SAM family protein  33.04 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  29.17 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  22.41 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.07 
 
 		 342 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.07 
 
 		 342 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  27.22 
 
 		 352 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  33.02 
 
 		 415 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.21 
 
 		 349 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  22.62 
 
 		 347 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2557  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.37 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 380 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 351 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  29.82 
 
 		 421 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  26.63 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 395 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  27.67 
 
 		 391 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 		 396 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  30.33 
 
 		 397 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1919  hypothetical protein  21.74 
 
 		 523 aa  46.2  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00679545  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  30.91 
 
 		 393 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  21.96 
 
 		 338 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  27.22 
 
 		 352 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  27.4 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  23.58 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>