203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0795 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0795  Radical SAM domain protein  100 
 
 
296 aa  608  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1043  radical SAM domain-containing protein  35.42 
 
 
297 aa  199  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  38.14 
 
 
292 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  38.28 
 
 
292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3973  radical SAM domain-containing protein  37.8 
 
 
292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  37.93 
 
 
292 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  37.93 
 
 
292 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  37.93 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  37.93 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  37.93 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  37.93 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  37.93 
 
 
292 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1692  radical SAM family protein  36.3 
 
 
290 aa  194  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0122  Radical SAM domain protein  34.95 
 
 
289 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5367  hypothetical protein  37.63 
 
 
279 aa  182  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0445867  hitchhiker  0.0000016486 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1690  Radical SAM domain protein  35.86 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1605  hypothetical protein  28.18 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0132  radical SAM domain protein  29.58 
 
 
285 aa  142  7e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.717218  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1747  radical SAM family protein  29.5 
 
 
264 aa  125  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  23.36 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  22.8 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 
364 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  21.93 
 
 
341 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  21.38 
 
 
342 aa  62.4  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.56 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4147  molybdenum cofactor synthesis-like  32.46 
 
 
322 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115526  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0480  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 
281 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00535769  hitchhiker  0.00252735 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  19.68 
 
 
358 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  20 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 
323 aa  57  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  30.15 
 
 
326 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  23.13 
 
 
338 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1849  Radical SAM domain protein  23.16 
 
 
310 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  36.67 
 
 
355 aa  56.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0761  radical SAM family protein  24.42 
 
 
503 aa  55.8  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.510153  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8972  Radical SAM domain protein  31.3 
 
 
364 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215472  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  30.7 
 
 
351 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  28.88 
 
 
351 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  29.03 
 
 
341 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  23.05 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 
565 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 
347 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  32.56 
 
 
468 aa  53.5  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  23.03 
 
 
347 aa  53.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 
323 aa  53.5  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  25.87 
 
 
413 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3406  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
330 aa  52.8  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  25.47 
 
 
358 aa  52.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  21.9 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1535  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  31.58 
 
 
322 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.63 
 
 
375 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  25.73 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0544  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.06 
 
 
334 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0055  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.38 
 
 
325 aa  50.1  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0195901 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 
347 aa  50.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4537  Radical SAM domain protein  23.71 
 
 
391 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A, putative  31.58 
 
 
337 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107564 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.63 
 
 
359 aa  49.3  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  25.38 
 
 
415 aa  48.5  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.89 
 
 
342 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2288  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.66 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 
390 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.89 
 
 
342 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.83 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7109  Fe-S oxidoreductase  34.18 
 
 
703 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345593  normal  0.70276 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1282  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.31 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.591085  normal  0.574415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.83 
 
 
348 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  32.94 
 
 
367 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1905  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.54 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349909  unclonable  0.0000106016 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  22.57 
 
 
373 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1500  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  28.95 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  31.19 
 
 
380 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.11 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3791  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  30.7 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0673819 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  23.97 
 
 
332 aa  47.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 
873 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
334 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  21.4 
 
 
349 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  30.15 
 
 
461 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  23.97 
 
 
360 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 
515 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  36.96 
 
 
397 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
453 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2557  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.37 
 
 
330 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 
471 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 
325 aa  47  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1064  radical SAM domain-containing protein  35.96 
 
 
365 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.468822  normal  0.968223 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1101  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.11 
 
 
310 aa  47  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 
345 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 
372 aa  47  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0928  radical SAM domain-containing protein  37.35 
 
 
355 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0991666  normal  0.304718 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  27.56 
 
 
451 aa  46.6  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  32.63 
 
 
338 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.57 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30 
 
 
325 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 
393 aa  46.2  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>