107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0188 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0188  radical SAM family protein  100 
 
 		 279 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3973  radical SAM domain-containing protein  36.52 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  33 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  26.58 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  34.69 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  30.66 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  30.66 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  30.66 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  30.66 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  30.66 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  32.99 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1043  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  30.66 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  30.66 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  30.66 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  30.66 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  23.97 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 		 341 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5367  hypothetical protein  30.3 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0445867  hitchhiker  0.0000016486 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  23.62 
 
 		 358 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  36.61 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 428 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 		 439 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  23.62 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1943  Radical SAM domain protein  33.98 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227047  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  39.13 
 
 		 284 aa  53.5  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 		 356 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  21.72 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 446 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  30.69 
 
 		 468 aa  50.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 453 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  21.4 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  28.42 
 
 		 392 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  35 
 
 		 346 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 434 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  33.93 
 
 		 357 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 394 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 		 393 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  22.82 
 
 		 338 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  30.39 
 
 		 349 aa  50.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 358 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  23.57 
 
 		 361 aa  49.7  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 358 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  29.32 
 
 		 367 aa  49.7  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.91 
 
 		 394 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 391 aa  49.3  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  30.11 
 
 		 372 aa  48.5  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3406  radical SAM domain-containing protein  19.16 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  33.04 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  23.28 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 395 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  33.03 
 
 		 354 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  28.03 
 
 		 394 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1348  Radical SAM domain protein  26.61 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  32.63 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  22.76 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  28.97 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  33.72 
 
 		 390 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  30.09 
 
 		 384 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4646  radical SAM domain-containing protein  23.61 
 
 		 371 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  31.68 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  29.91 
 
 		 393 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  25.18 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 377 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  34.38 
 
 		 359 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  28.23 
 
 		 445 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1326  hypothetical protein  22.86 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  21.83 
 
 		 355 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  32.04 
 
 		 367 aa  46.2  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 358 aa  46.2  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  21.93 
 
 		 515 aa  45.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2560  radical SAM family protein  25.83 
 
 		 369 aa  45.8  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0538253  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  34.78 
 
 		 393 aa  45.8  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 350 aa  45.4  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 347 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  20.45 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  30 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  29.2 
 
 		 366 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  28.3 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  27.48 
 
 		 471 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  32.56 
 
 		 565 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 		 459 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  24.37 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  21.11 
 
 		 574 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  22.76 
 
 		 396 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 450 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  21.92 
 
 		 405 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 380 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 415 aa  43.5  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  22.92 
 
 		 349 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 334 aa  43.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 		 399 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  25.42 
 
 		 391 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  22.85 
 
 		 316 aa  42.7  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3490  Radical SAM domain protein  25.47 
 
 		 346 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>