More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2349 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 873 aa  1836    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2274  radical SAM domain protein  46.43 
 
 		 266 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122382 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0670  hypothetical protein  41.04 
 
 		 273 aa  202  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.556304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1552  hypothetical protein  43.59 
 
 		 260 aa  196  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0418  hypothetical protein  41.56 
 
 		 304 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1769  hypothetical protein  36.89 
 
 		 575 aa  164  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.994372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  31.15 
 
 		 340 aa  152  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  29.74 
 
 		 339 aa  145  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  28.27 
 
 		 340 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  28.33 
 
 		 341 aa  130  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  26.46 
 
 		 358 aa  120  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 322 aa  117  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  26.53 
 
 		 349 aa  102  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 351 aa  91.3  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  23.69 
 
 		 351 aa  89  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 465 aa  85.9  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  22.15 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2787  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 349 aa  84  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4943  hypothetical protein  24.03 
 
 		 298 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.465908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1838  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1326  hypothetical protein  23.31 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 367 aa  77.4  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  25.1 
 
 		 445 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  25.67 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  21.01 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 446 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  26.91 
 
 		 338 aa  72.8  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 		 335 aa  72  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  20.18 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  23.78 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  24.62 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 446 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  24.7 
 
 		 349 aa  70.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 445 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 461 aa  69.7  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 		 421 aa  70.1  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0417  hypothetical protein  25.3 
 
 		 288 aa  70.1  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  35.78 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  24.25 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  28.33 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0480  Radical SAM domain protein  22.46 
 
 		 281 aa  67  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00535769  hitchhiker  0.00252735 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  22.87 
 
 		 397 aa  66.6  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  23.25 
 
 		 330 aa  66.6  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 380 aa  66.6  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 		 451 aa  67  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  22.99 
 
 		 471 aa  67  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.89 
 
 		 397 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 384 aa  66.6  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 380 aa  66.6  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  29.61 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 		 407 aa  66.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  30.87 
 
 		 409 aa  66.6  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  30.51 
 
 		 422 aa  67  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0744  hypothetical protein  24.64 
 
 		 237 aa  66.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  26.18 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0040  hypothetical protein  23.69 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  23.9 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  24.6 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  24.02 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  23.44 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  23.46 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  31.72 
 
 		 338 aa  63.9  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  27.14 
 
 		 347 aa  64.3  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  21.83 
 
 		 393 aa  63.9  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 377 aa  63.5  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  31.33 
 
 		 394 aa  63.9  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 384 aa  63.9  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 		 843 aa  63.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  23.31 
 
 		 317 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 399 aa  63.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  26.01 
 
 		 769 aa  63.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  29.29 
 
 		 301 aa  63.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 		 453 aa  63.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2577  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 371 aa  63.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.014973  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  22.05 
 
 		 367 aa  62.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3737  hypothetical protein  24.61 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  22.68 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  22.26 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 399 aa  62  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  27.46 
 
 		 561 aa  61.2  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  22.56 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>