More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0838 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 465 aa  964    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  52.94 
 
 		 446 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  55.44 
 
 		 421 aa  463  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  54.01 
 
 		 433 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  48.37 
 
 		 446 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  47.67 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  48.44 
 
 		 451 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  48.74 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  49.33 
 
 		 450 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  47.71 
 
 		 471 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  46.64 
 
 		 447 aa  435  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  41.8 
 
 		 437 aa  383  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  39.11 
 
 		 461 aa  338  9e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  36.33 
 
 		 513 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 		 434 aa  195  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 		 345 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  35.11 
 
 		 372 aa  95.9  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  23.02 
 
 		 355 aa  87.8  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 873 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  33.07 
 
 		 384 aa  86.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  26.37 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.26 
 
 		 345 aa  76.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  22.28 
 
 		 341 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  22.68 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  27.45 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0518  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.4 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.5 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  26.86 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.57 
 
 		 298 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.19 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.19 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  28.79 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  28.06 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0285  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.94 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.91 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.48 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.21 
 
 		 337 aa  67  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.62159  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0281  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.94 
 
 		 337 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.94 
 
 		 337 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0284  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.94 
 
 		 337 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0274  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.64 
 
 		 337 aa  67  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.481355  hitchhiker  0.000000283417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  26.36 
 
 		 335 aa  67  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  24.74 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  22.48 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.97 
 
 		 298 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  22.84 
 
 		 340 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.73 
 
 		 349 aa  66.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.74 
 
 		 326 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  23.43 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.52 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.55 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.105392  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4452  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.64 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.06 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000395705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.06 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247867  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.03 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1978  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.9 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.633092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.03 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.04 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0726  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.22 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130382 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.51 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  28.16 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1233  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.11 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63882  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2247  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.55 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2272  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.56 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.25 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2191  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.17 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  22.81 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.36 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19300  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.73 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00282794  normal  0.0296768 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.85 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.54 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292381  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.85 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0480  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 281 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00535769  hitchhiker  0.00252735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3898  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.7 
 
 		 350 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.65 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.54 
 
 		 373 aa  63.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.02 
 
 		 343 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0948  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.11 
 
 		 344 aa  63.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.36 
 
 		 326 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.09 
 
 		 326 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.72 
 
 		 329 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1755  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.8 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.88 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>