12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0418 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0418  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0670  hypothetical protein  45.73 
 
 		 273 aa  205  7e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.556304  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  41.56 
 
 		 873 aa  165  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2274  radical SAM domain protein  40.45 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1552  hypothetical protein  40.27 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1769  hypothetical protein  39.55 
 
 		 575 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.994372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0374  hypothetical protein  30.77 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0744  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4835  hypothetical protein  25.47 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.05102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2586  hypothetical protein  26.67 
 
 		 272 aa  45.8  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2265  hypothetical protein  25.43 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3183  hypothetical protein  28.19 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>