12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1552 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1552  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  534  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2274  radical SAM domain protein  53.49 
 
 		 266 aa  280  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  43.59 
 
 		 873 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0670  hypothetical protein  46.67 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.556304  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1769  hypothetical protein  36.89 
 
 		 575 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.994372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0418  hypothetical protein  40.27 
 
 		 304 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0744  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2265  hypothetical protein  24.86 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0374  hypothetical protein  40.24 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3183  hypothetical protein  33.64 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4835  hypothetical protein  27.14 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.05102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2586  hypothetical protein  26.49 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>