40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1769 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1769  hypothetical protein  100 
 
 
575 aa  1166    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.994372  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0670  hypothetical protein  36.9 
 
 
273 aa  178  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.556304  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  36.89 
 
 
873 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2274  radical SAM domain protein  36.04 
 
 
266 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00122382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1552  hypothetical protein  36.89 
 
 
260 aa  153  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.676726 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0418  hypothetical protein  39.55 
 
 
304 aa  145  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1240  hypothetical protein  35.95 
 
 
325 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.970781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4043  sugar transferase  27.21 
 
 
299 aa  113  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.735455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0642  hypothetical protein  31.27 
 
 
305 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4790  putative glycosyltransferase  30.96 
 
 
297 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0205382 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.93 
 
 
2401 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4352  glycosyltransferase  29.18 
 
 
298 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0669  sugar transferase  28.16 
 
 
298 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3282  sugar transferase  28.34 
 
 
318 aa  103  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0718  hypothetical protein  28.74 
 
 
303 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0882168  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1851  hypothetical protein  28.77 
 
 
313 aa  100  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.342351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2282  hemolytic protein HlpA-like protein  27.98 
 
 
300 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00141724  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2567  glycosyltransferase  30.57 
 
 
299 aa  99.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2883  sugar transferase  26.89 
 
 
303 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1653  hemolytic protein HlpA-like protein  28.19 
 
 
313 aa  92  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0742  hypothetical protein  25.38 
 
 
307 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2514  hypothetical protein  22.39 
 
 
308 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.760673  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0057  hypothetical protein  24.08 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0366699  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1042  methyltransferase FkbM  23.72 
 
 
550 aa  83.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000399946  hitchhiker  0.00660065 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0941  hypothetical protein  27.03 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  23.68 
 
 
2490 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0958  hypothetical protein  27.03 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1383  hemolytic protein HlpA-like  23.88 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0265582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1958  sugar transferase  23.95 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0307  hemolytic protein hlpA-like protein  25.83 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13841  hypothetical protein  22.83 
 
 
314 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0744  hypothetical protein  28.7 
 
 
237 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1398  protein containing nucleotide-diphospho-sugar transferase domain  20.9 
 
 
326 aa  65.1  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735856  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1370  hemolytic protein HlpA-like protein  22.03 
 
 
333 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196526  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1609  hypothetical protein  24.07 
 
 
416 aa  54.3  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.477437  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1607  hypothetical protein  17.92 
 
 
406 aa  53.5  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3500  hemolytic protein HlpA-like protein  20.08 
 
 
339 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0374  hypothetical protein  27.22 
 
 
265 aa  50.8  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2586  hypothetical protein  28.57 
 
 
272 aa  48.5  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1610  hypothetical protein  22.42 
 
 
410 aa  47  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.353849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>