32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4352 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4352  glycosyltransferase  100 
 
 
298 aa  625  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0718  hypothetical protein  49.66 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0882168  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4790  putative glycosyltransferase  42.21 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0205382 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0669  sugar transferase  37.4 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2567  glycosyltransferase  35.18 
 
 
299 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0642  hypothetical protein  34.69 
 
 
305 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1240  hypothetical protein  35.92 
 
 
325 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.970781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4043  sugar transferase  33.07 
 
 
299 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.735455 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1851  hypothetical protein  29.89 
 
 
313 aa  145  9e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.342351 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  32.31 
 
 
2401 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1653  hemolytic protein HlpA-like protein  31.68 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3282  sugar transferase  33.11 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0057  hypothetical protein  30.3 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0366699  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2883  sugar transferase  30.92 
 
 
303 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0958  hypothetical protein  30.56 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0941  hypothetical protein  30.56 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1042  methyltransferase FkbM  26.52 
 
 
550 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000399946  hitchhiker  0.00660065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  27.56 
 
 
2490 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13841  hypothetical protein  28.74 
 
 
314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1769  hypothetical protein  29.18 
 
 
575 aa  108  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.994372  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2282  hemolytic protein HlpA-like protein  30.4 
 
 
300 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00141724  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0307  hemolytic protein hlpA-like protein  28.06 
 
 
302 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1383  hemolytic protein HlpA-like  28.57 
 
 
308 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0265582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2514  hypothetical protein  26.04 
 
 
308 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.760673  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0742  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  92.8  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1958  sugar transferase  29.36 
 
 
357 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1398  protein containing nucleotide-diphospho-sugar transferase domain  26.12 
 
 
326 aa  89.4  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3500  hemolytic protein HlpA-like protein  23.88 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1370  hemolytic protein HlpA-like protein  25 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196526  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1607  hypothetical protein  20.56 
 
 
406 aa  58.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1610  hypothetical protein  19.29 
 
 
410 aa  53.9  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.353849  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1609  hypothetical protein  21.64 
 
 
416 aa  52  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.477437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>