32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0718 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0718  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  631  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0882168  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4352  glycosyltransferase  49.66 
 
 
298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4790  putative glycosyltransferase  43.92 
 
 
297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0205382 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0669  sugar transferase  36.82 
 
 
298 aa  151  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2567  glycosyltransferase  35.17 
 
 
299 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1851  hypothetical protein  31.37 
 
 
313 aa  147  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.342351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4043  sugar transferase  30.72 
 
 
299 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.735455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0642  hypothetical protein  34.18 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1240  hypothetical protein  32.49 
 
 
325 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.970781 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2883  sugar transferase  37.39 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0057  hypothetical protein  30.45 
 
 
308 aa  119  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0366699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.41 
 
 
2401 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3282  sugar transferase  33.76 
 
 
318 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0958  hypothetical protein  27.62 
 
 
311 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0941  hypothetical protein  27.62 
 
 
311 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1653  hemolytic protein HlpA-like protein  29.3 
 
 
313 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1769  hypothetical protein  28.74 
 
 
575 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.994372  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1383  hemolytic protein HlpA-like  27.87 
 
 
308 aa  95.9  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0265582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1958  sugar transferase  29.54 
 
 
357 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0307  hemolytic protein hlpA-like protein  25.94 
 
 
302 aa  92.8  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2514  hypothetical protein  25.38 
 
 
308 aa  90.1  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.760673  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2282  hemolytic protein HlpA-like protein  29.46 
 
 
300 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00141724  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0742  hypothetical protein  25.62 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1042  methyltransferase FkbM  29.48 
 
 
550 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000399946  hitchhiker  0.00660065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1370  hemolytic protein HlpA-like protein  29.76 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196526  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13841  hypothetical protein  26.32 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  30.64 
 
 
2490 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1398  protein containing nucleotide-diphospho-sugar transferase domain  25.21 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3500  hemolytic protein HlpA-like protein  24.5 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1610  hypothetical protein  21.89 
 
 
410 aa  60.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.353849  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1609  hypothetical protein  22.78 
 
 
416 aa  58.5  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.477437  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1607  hypothetical protein  20.48 
 
 
406 aa  48.9  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>