30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1607 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1607  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  817    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1609  hypothetical protein  32.66 
 
 
416 aa  189  8e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.477437  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1610  hypothetical protein  31.65 
 
 
410 aa  176  9e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.353849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1398  protein containing nucleotide-diphospho-sugar transferase domain  34.28 
 
 
326 aa  151  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735856  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0742  hypothetical protein  31.3 
 
 
307 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2514  hypothetical protein  32.27 
 
 
308 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.760673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1383  hemolytic protein HlpA-like  29.15 
 
 
308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0265582 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13841  hypothetical protein  29.76 
 
 
314 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3500  hemolytic protein HlpA-like protein  28 
 
 
339 aa  116  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1653  hemolytic protein HlpA-like protein  27.02 
 
 
313 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2282  hemolytic protein HlpA-like protein  24.31 
 
 
300 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00141724  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  26.29 
 
 
2490 aa  99.8  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1042  methyltransferase FkbM  27.53 
 
 
550 aa  99.8  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000399946  hitchhiker  0.00660065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1370  hemolytic protein HlpA-like protein  22.06 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196526  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0307  hemolytic protein hlpA-like protein  27.82 
 
 
302 aa  94  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  22.31 
 
 
2401 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0057  hypothetical protein  22.99 
 
 
308 aa  65.1  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0366699  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2567  glycosyltransferase  20.52 
 
 
299 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1958  sugar transferase  24.68 
 
 
357 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1851  hypothetical protein  19.58 
 
 
313 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.342351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4352  glycosyltransferase  20.56 
 
 
298 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1240  hypothetical protein  19.75 
 
 
325 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.970781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0958  hypothetical protein  22.38 
 
 
311 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0941  hypothetical protein  22.38 
 
 
311 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0642  hypothetical protein  19.46 
 
 
305 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1769  hypothetical protein  17.92 
 
 
575 aa  53.5  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.994372  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0718  hypothetical protein  20.48 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0882168  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4043  sugar transferase  20.09 
 
 
299 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.735455 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2883  sugar transferase  22.06 
 
 
303 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4790  putative glycosyltransferase  16.74 
 
 
297 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0205382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>