32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1370 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1370  hemolytic protein HlpA-like protein  100 
 
 
333 aa  696    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196526  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3500  hemolytic protein HlpA-like protein  53.31 
 
 
339 aa  359  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1383  hemolytic protein HlpA-like  31.76 
 
 
308 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0265582 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1653  hemolytic protein HlpA-like protein  32.2 
 
 
313 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1042  methyltransferase FkbM  29.5 
 
 
550 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000399946  hitchhiker  0.00660065 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0307  hemolytic protein hlpA-like protein  32.14 
 
 
302 aa  146  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0742  hypothetical protein  33.45 
 
 
307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1398  protein containing nucleotide-diphospho-sugar transferase domain  27.69 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  29.39 
 
 
2490 aa  132  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2514  hypothetical protein  31.21 
 
 
308 aa  126  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.760673  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13841  hypothetical protein  27.78 
 
 
314 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2282  hemolytic protein HlpA-like protein  26 
 
 
300 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00141724  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1607  hypothetical protein  22.06 
 
 
406 aa  95.1  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1609  hypothetical protein  25.69 
 
 
416 aa  90.1  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.477437  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1610  hypothetical protein  23.31 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.353849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0718  hypothetical protein  29.76 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0882168  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0642  hypothetical protein  27.17 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4352  glycosyltransferase  25 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1240  hypothetical protein  25.79 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.970781 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0669  sugar transferase  27.41 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4790  putative glycosyltransferase  24.51 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0205382 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1851  hypothetical protein  24.21 
 
 
313 aa  67  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.342351 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.61 
 
 
2401 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4043  sugar transferase  21.97 
 
 
299 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.735455 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0057  hypothetical protein  27.78 
 
 
308 aa  59.3  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0366699  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0941  hypothetical protein  22.48 
 
 
311 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0958  hypothetical protein  22.48 
 
 
311 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1769  hypothetical protein  22.03 
 
 
575 aa  56.6  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.994372  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2567  glycosyltransferase  24.9 
 
 
299 aa  56.2  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1958  sugar transferase  23.81 
 
 
357 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2883  sugar transferase  26.44 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3282  sugar transferase  20.98 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>