32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2567 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2567  glycosyltransferase  100 
 
 		 299 aa  616  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0669  sugar transferase  48.2 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4043  sugar transferase  41.16 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.735455 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2883  sugar transferase  45.42 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1851  hypothetical protein  37.09 
 
 		 313 aa  185  9e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.342351 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0642  hypothetical protein  37.86 
 
 		 305 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4790  putative glycosyltransferase  37.99 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0205382 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3282  sugar transferase  38.57 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1240  hypothetical protein  37.14 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.970781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0941  hypothetical protein  36.25 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0958  hypothetical protein  36.25 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4352  glycosyltransferase  35.18 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.81 
 
 		 2401 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0718  hypothetical protein  35.17 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0882168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0057  hypothetical protein  29.89 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0366699  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1042  methyltransferase FkbM  29.96 
 
 		 550 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000399946  hitchhiker  0.00660065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1653  hemolytic protein HlpA-like protein  29.32 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1383  hemolytic protein HlpA-like  25.32 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0265582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2282  hemolytic protein HlpA-like protein  28.39 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00141724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1769  hypothetical protein  30.26 
 
 		 575 aa  99.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.994372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2514  hypothetical protein  24.14 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.760673  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0307  hemolytic protein hlpA-like protein  26 
 
 		 302 aa  95.9  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1398  protein containing nucleotide-diphospho-sugar transferase domain  25.61 
 
 		 326 aa  88.2  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  25.85 
 
 		 2490 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0742  hypothetical protein  25.32 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13841  hypothetical protein  24.69 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1958  sugar transferase  25.52 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3500  hemolytic protein HlpA-like protein  21.4 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1607  hypothetical protein  20.52 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1370  hemolytic protein HlpA-like protein  24.9 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196526  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1609  hypothetical protein  21.34 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.477437  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1610  hypothetical protein  24.24 
 
 		 410 aa  50.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.353849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>