32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0307 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0307  hemolytic protein hlpA-like protein  100 
 
 		 302 aa  634    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1042  methyltransferase FkbM  48.99 
 
 		 550 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000399946  hitchhiker  0.00660065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  47.04 
 
 		 2490 aa  296  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1383  hemolytic protein HlpA-like  46.81 
 
 		 308 aa  293  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0265582 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1653  hemolytic protein HlpA-like protein  41.72 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2514  hypothetical protein  46.5 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.760673  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2282  hemolytic protein HlpA-like protein  40.54 
 
 		 300 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00141724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0742  hypothetical protein  42.4 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13841  hypothetical protein  37.79 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1398  protein containing nucleotide-diphospho-sugar transferase domain  37.17 
 
 		 326 aa  206  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3500  hemolytic protein HlpA-like protein  32.32 
 
 		 339 aa  149  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1370  hemolytic protein HlpA-like protein  32.14 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196526  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1610  hypothetical protein  30.32 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.353849  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1609  hypothetical protein  28.29 
 
 		 416 aa  109  7.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.477437  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4352  glycosyltransferase  28.06 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1851  hypothetical protein  26.04 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.342351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2567  glycosyltransferase  26 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.1 
 
 		 2401 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1607  hypothetical protein  27.82 
 
 		 406 aa  94  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0718  hypothetical protein  25.94 
 
 		 303 aa  92.8  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0882168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0642  hypothetical protein  27.67 
 
 		 305 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4043  sugar transferase  23.05 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.735455 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0669  sugar transferase  24.92 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1240  hypothetical protein  26.21 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.970781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4790  putative glycosyltransferase  25.2 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0205382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0941  hypothetical protein  22.98 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0958  hypothetical protein  22.98 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1958  sugar transferase  28.69 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2883  sugar transferase  25.21 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1769  hypothetical protein  25.83 
 
 		 575 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.994372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0057  hypothetical protein  24.51 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0366699  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3282  sugar transferase  23.19 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>