32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4790 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4790  putative glycosyltransferase  100 
 
 		 297 aa  619  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0205382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4352  glycosyltransferase  39.93 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0718  hypothetical protein  43.92 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0882168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4043  sugar transferase  39.59 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.735455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2567  glycosyltransferase  40.42 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0669  sugar transferase  42.56 
 
 		 298 aa  178  9e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1851  hypothetical protein  38.37 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.342351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2883  sugar transferase  38.37 
 
 		 303 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0642  hypothetical protein  36.36 
 
 		 305 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3282  sugar transferase  40.08 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  31.47 
 
 		 2401 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1240  hypothetical protein  39.59 
 
 		 325 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.970781 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0057  hypothetical protein  31.18 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0366699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0958  hypothetical protein  31.84 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0941  hypothetical protein  31.84 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1769  hypothetical protein  30.96 
 
 		 575 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.994372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1653  hemolytic protein HlpA-like protein  28.57 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1398  protein containing nucleotide-diphospho-sugar transferase domain  25 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735856  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1958  sugar transferase  28.1 
 
 		 357 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13841  hypothetical protein  25 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0307  hemolytic protein hlpA-like protein  25.2 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1383  hemolytic protein HlpA-like  23.72 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0265582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2514  hypothetical protein  22.92 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.760673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1042  methyltransferase FkbM  22.74 
 
 		 550 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000399946  hitchhiker  0.00660065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2282  hemolytic protein HlpA-like protein  23.02 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00141724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1370  hemolytic protein HlpA-like protein  24.51 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196526  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  21.09 
 
 		 2490 aa  72.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0742  hypothetical protein  21.45 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3500  hemolytic protein HlpA-like protein  22.62 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1609  hypothetical protein  22.05 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.477437  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1610  hypothetical protein  22.41 
 
 		 410 aa  53.1  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.353849  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1607  hypothetical protein  16.74 
 
 		 406 aa  43.5  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>