32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1653 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1653  hemolytic protein HlpA-like protein  100 
 
 
313 aa  651    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  48.78 
 
 
2490 aa  324  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1042  methyltransferase FkbM  47.69 
 
 
550 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000399946  hitchhiker  0.00660065 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0307  hemolytic protein hlpA-like protein  41.72 
 
 
302 aa  290  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1383  hemolytic protein HlpA-like  42.76 
 
 
308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0265582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2514  hypothetical protein  39.93 
 
 
308 aa  256  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.760673  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2282  hemolytic protein HlpA-like protein  40.78 
 
 
300 aa  232  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00141724  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0742  hypothetical protein  37.32 
 
 
307 aa  215  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1398  protein containing nucleotide-diphospho-sugar transferase domain  35.44 
 
 
326 aa  204  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735856  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13841  hypothetical protein  33.78 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1370  hemolytic protein HlpA-like protein  32.2 
 
 
333 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196526  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3500  hemolytic protein HlpA-like protein  31.23 
 
 
339 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4352  glycosyltransferase  31.68 
 
 
298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0642  hypothetical protein  32.39 
 
 
305 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2567  glycosyltransferase  29.32 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4043  sugar transferase  27.48 
 
 
299 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.735455 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1610  hypothetical protein  25.5 
 
 
410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.353849  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1609  hypothetical protein  24.21 
 
 
416 aa  110  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.477437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.39 
 
 
2401 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1607  hypothetical protein  27.02 
 
 
406 aa  108  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0718  hypothetical protein  29.3 
 
 
303 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0882168  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4790  putative glycosyltransferase  28.57 
 
 
297 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0205382 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0669  sugar transferase  25.82 
 
 
298 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1851  hypothetical protein  25.93 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.342351 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1240  hypothetical protein  27.46 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.970781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1769  hypothetical protein  28.19 
 
 
575 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.994372  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0958  hypothetical protein  24.71 
 
 
311 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0941  hypothetical protein  24.71 
 
 
311 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2883  sugar transferase  24.17 
 
 
303 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1958  sugar transferase  25.39 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3282  sugar transferase  23.97 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0057  hypothetical protein  23.46 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0366699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>