29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3282 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3282  sugar transferase  100 
 
 
318 aa  664    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2883  sugar transferase  55.04 
 
 
303 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0669  sugar transferase  45.58 
 
 
298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4043  sugar transferase  38.49 
 
 
299 aa  239  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.735455 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1240  hypothetical protein  41.15 
 
 
325 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.970781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2567  glycosyltransferase  40.7 
 
 
299 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0642  hypothetical protein  34.63 
 
 
305 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4790  putative glycosyltransferase  40.08 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0205382 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1851  hypothetical protein  35.06 
 
 
313 aa  166  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.342351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4352  glycosyltransferase  33.11 
 
 
298 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0057  hypothetical protein  34.9 
 
 
308 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0366699  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0941  hypothetical protein  32.5 
 
 
311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0958  hypothetical protein  32.5 
 
 
311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  30.3 
 
 
2401 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0718  hypothetical protein  33.76 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0882168  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1769  hypothetical protein  28.34 
 
 
575 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.994372  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  25.56 
 
 
2490 aa  99.8  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1383  hemolytic protein HlpA-like  22.93 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0265582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2282  hemolytic protein HlpA-like protein  25.2 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00141724  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1653  hemolytic protein HlpA-like protein  23.97 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0307  hemolytic protein hlpA-like protein  23.55 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1042  methyltransferase FkbM  21.63 
 
 
550 aa  76.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000399946  hitchhiker  0.00660065 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13841  hypothetical protein  23.44 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2514  hypothetical protein  21.81 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.760673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1958  sugar transferase  24.58 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1398  protein containing nucleotide-diphospho-sugar transferase domain  21.1 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735856  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0742  hypothetical protein  21.14 
 
 
307 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1370  hemolytic protein HlpA-like protein  20.98 
 
 
333 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196526  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1609  hypothetical protein  24.22 
 
 
416 aa  48.5  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.477437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>