31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0669 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0669  sugar transferase  100 
 
 
298 aa  624  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2567  glycosyltransferase  48.2 
 
 
299 aa  277  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4043  sugar transferase  41.67 
 
 
299 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.735455 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2883  sugar transferase  50 
 
 
303 aa  235  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3282  sugar transferase  45.58 
 
 
318 aa  226  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0642  hypothetical protein  39.23 
 
 
305 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1240  hypothetical protein  35.1 
 
 
325 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.970781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4790  putative glycosyltransferase  42.56 
 
 
297 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0205382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4352  glycosyltransferase  37.4 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.992938 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1851  hypothetical protein  36.48 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.342351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0941  hypothetical protein  33.08 
 
 
311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0958  hypothetical protein  33.08 
 
 
311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0718  hypothetical protein  36.82 
 
 
303 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0882168  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0057  hypothetical protein  34.68 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0366699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  30.71 
 
 
2401 aa  135  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1042  methyltransferase FkbM  28.17 
 
 
550 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000399946  hitchhiker  0.00660065 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1769  hypothetical protein  28.16 
 
 
575 aa  105  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.994372  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1653  hemolytic protein HlpA-like protein  25.82 
 
 
313 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2282  hemolytic protein HlpA-like protein  27.2 
 
 
300 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00141724  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
2490 aa  99.4  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1383  hemolytic protein HlpA-like  25.1 
 
 
308 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0265582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2514  hypothetical protein  26.69 
 
 
308 aa  93.2  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.760673  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0307  hemolytic protein hlpA-like protein  24.92 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0742  hypothetical protein  25.76 
 
 
307 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1958  sugar transferase  26.56 
 
 
357 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1398  protein containing nucleotide-diphospho-sugar transferase domain  24.9 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735856  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13841  hypothetical protein  24.11 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1370  hemolytic protein HlpA-like protein  27.41 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196526  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3500  hemolytic protein HlpA-like protein  25.55 
 
 
339 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1609  hypothetical protein  24.65 
 
 
416 aa  59.3  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.477437  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1610  hypothetical protein  25.9 
 
 
410 aa  44.3  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.353849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>