More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0885 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  100 
 
 
392 aa  815    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  47.55 
 
 
1301 aa  159  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  37.67 
 
 
1038 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
299 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  32.45 
 
 
311 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
314 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 
316 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
398 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
310 aa  106  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.16 
 
 
312 aa  106  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  35.41 
 
 
300 aa  106  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  31.8 
 
 
272 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 
330 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  43.4 
 
 
345 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  37.19 
 
 
339 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  36.71 
 
 
318 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
333 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
326 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
305 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 
1250 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
373 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  43.93 
 
 
341 aa  99.8  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  37.19 
 
 
340 aa  99.4  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
324 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
362 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 
316 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
302 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.02 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
313 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
704 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
318 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
350 aa  97.8  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
310 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
321 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
289 aa  97.1  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
303 aa  96.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
321 aa  96.3  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  39.64 
 
 
340 aa  96.3  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 
544 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
324 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  34.01 
 
 
276 aa  94  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
320 aa  94  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
305 aa  94  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2737  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
482 aa  94  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0308026  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 
334 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  38.05 
 
 
341 aa  93.6  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  32 
 
 
338 aa  93.6  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 
597 aa  93.6  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 
351 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
347 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 
268 aa  93.6  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
308 aa  92.8  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
1032 aa  92.8  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
297 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
261 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
983 aa  92  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.69 
 
 
317 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  29.3 
 
 
296 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
233 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
812 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 
379 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  27.31 
 
 
306 aa  90.9  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
309 aa  90.1  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 
327 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 
261 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
317 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4067  glycosyl transferase  35.11 
 
 
1076 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
347 aa  89.7  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  30.14 
 
 
255 aa  89.7  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
294 aa  89.4  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
291 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
322 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.38 
 
 
292 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.43 
 
 
314 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  42.59 
 
 
324 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 
342 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  42.59 
 
 
333 aa  87.8  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  26.58 
 
 
309 aa  87.8  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
235 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
337 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
318 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
397 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
325 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.67 
 
 
310 aa  86.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 
1562 aa  86.7  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
261 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
301 aa  86.3  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
344 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
1177 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.29 
 
 
350 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
1177 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
347 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.41 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>