More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3028 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
704 aa  1431    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07651  glycosyltransferase  29.11 
 
 
365 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457452  hitchhiker  0.00512375 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 
313 aa  143  8e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  42.16 
 
 
302 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
377 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  32.25 
 
 
389 aa  134  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
377 aa  130  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 
321 aa  130  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  41.08 
 
 
324 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  56 
 
 
321 aa  127  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  40.32 
 
 
330 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
398 aa  127  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  36.22 
 
 
341 aa  126  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  36.46 
 
 
305 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  48.09 
 
 
345 aa  125  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.65 
 
 
321 aa  125  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
401 aa  124  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  37.77 
 
 
316 aa  124  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  27.32 
 
 
369 aa  123  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  37.97 
 
 
333 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  39.69 
 
 
324 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
318 aa  122  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
327 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  36.81 
 
 
299 aa  120  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.2 
 
 
295 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
373 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  40.11 
 
 
689 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 
318 aa  119  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
337 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 
350 aa  117  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
378 aa  117  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  40.48 
 
 
337 aa  115  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  34.9 
 
 
327 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.9 
 
 
327 aa  114  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  34.9 
 
 
327 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.9 
 
 
327 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.51 
 
 
312 aa  114  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  37.1 
 
 
314 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
376 aa  113  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3453  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
347 aa  113  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
344 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 
373 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
327 aa  111  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  41.46 
 
 
347 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.55 
 
 
327 aa  111  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
333 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
394 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.03 
 
 
327 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.81 
 
 
326 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
1301 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  39.04 
 
 
300 aa  110  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.45 
 
 
326 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.28 
 
 
326 aa  109  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 
334 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  47.93 
 
 
330 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
672 aa  108  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 
348 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
395 aa  108  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
382 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.26 
 
 
326 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
322 aa  108  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  47.01 
 
 
1015 aa  108  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 
597 aa  108  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 
326 aa  108  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
333 aa  108  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
310 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  34.47 
 
 
374 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  50 
 
 
338 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
369 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
1035 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
812 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
727 aa  106  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  35.75 
 
 
331 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.81 
 
 
366 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
367 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  26.81 
 
 
366 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
376 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.81 
 
 
366 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  26.81 
 
 
366 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 
381 aa  105  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  36.47 
 
 
379 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  40.56 
 
 
310 aa  105  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  26.51 
 
 
366 aa  104  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.66 
 
 
745 aa  104  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  37.29 
 
 
390 aa  104  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
367 aa  104  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 
325 aa  104  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  42.98 
 
 
311 aa  103  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
390 aa  104  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  36.6 
 
 
386 aa  103  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
307 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
387 aa  103  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
383 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  24.87 
 
 
369 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
397 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
387 aa  103  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  26.23 
 
 
371 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 
366 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  41.13 
 
 
1177 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  41.13 
 
 
1177 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>