More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01306 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
366 aa  755    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  66.76 
 
 
374 aa  487  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  36.61 
 
 
370 aa  226  7e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
380 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  27.57 
 
 
371 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 
363 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
378 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.45 
 
 
373 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
396 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
399 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
390 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
377 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
379 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 
373 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
398 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
376 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
371 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
391 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
398 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
387 aa  112  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
389 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
412 aa  109  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
374 aa  109  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.81 
 
 
366 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
376 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.39 
 
 
419 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
383 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
385 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  26.18 
 
 
371 aa  107  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
394 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  27.89 
 
 
388 aa  106  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 
372 aa  105  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
390 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 
373 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.52 
 
 
407 aa  104  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
371 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 
360 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
398 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
412 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  26.73 
 
 
369 aa  102  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  23.45 
 
 
395 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
360 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  27.59 
 
 
383 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
382 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
704 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
364 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
403 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  26.68 
 
 
370 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
388 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  26.37 
 
 
371 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
374 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
364 aa  100  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 
379 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
381 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 
367 aa  99.8  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2857  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
379 aa  99.4  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  21.96 
 
 
745 aa  99.4  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
409 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2949  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
379 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244554  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
389 aa  99  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
379 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  26.03 
 
 
346 aa  99.4  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
387 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2765  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
379 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
394 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.08 
 
 
365 aa  98.6  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 
378 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
378 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
361 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1064  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
369 aa  98.6  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.289195  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.53 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
387 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 
348 aa  97.8  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
412 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
377 aa  97.4  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
378 aa  97.4  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
384 aa  97.8  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 
399 aa  97.4  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.46 
 
 
396 aa  97.1  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
419 aa  97.1  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
382 aa  97.1  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
385 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  25.07 
 
 
371 aa  97.1  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
389 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
390 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 
371 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 
364 aa  96.3  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 
390 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
367 aa  95.9  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  25.26 
 
 
388 aa  95.9  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>