More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0825 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
382 aa  775    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  41.55 
 
 
369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  40.55 
 
 
389 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  39.13 
 
 
383 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  33.76 
 
 
388 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  37.23 
 
 
401 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 
388 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  36.46 
 
 
367 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  36.19 
 
 
367 aa  189  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  38.44 
 
 
373 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 
394 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
390 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 
378 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
378 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
395 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
392 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 
388 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 
377 aa  144  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.49 
 
 
356 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
387 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
398 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.77 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.36 
 
 
349 aa  133  6e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 
379 aa  132  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.5 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
389 aa  130  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
398 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1064  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 
369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.289195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
399 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
374 aa  126  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
374 aa  126  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
376 aa  126  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
389 aa  126  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0495  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
387 aa  125  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
394 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
689 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  29.53 
 
 
393 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 
384 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.85 
 
 
388 aa  123  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
385 aa  122  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
391 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
396 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  35.02 
 
 
413 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
373 aa  119  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  28.61 
 
 
745 aa  119  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
384 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 
390 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0487  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
394 aa  116  7.999999999999999e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000304875  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
1079 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  32.29 
 
 
382 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  33.23 
 
 
403 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
367 aa  113  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
412 aa  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
374 aa  112  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.48 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
366 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.48 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
369 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0268  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
387 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.48 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  33.48 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  33.48 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  33.48 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.48 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 
387 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.48 
 
 
381 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0060  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 
656 aa  109  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19162  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 
371 aa  110  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 
380 aa  110  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
371 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  24.02 
 
 
377 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
377 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  25.73 
 
 
366 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
383 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
1080 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.73 
 
 
366 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  23.95 
 
 
367 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  26.82 
 
 
350 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
387 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
382 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>