More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0204 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
377 aa  765    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0185  glycosyl transferase, group 1  53.39 
 
 
385 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.634207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0320  glycosyl transferase group 1  51.96 
 
 
373 aa  329  6e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527703  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0268  glycosyl transferase, group 1  52.2 
 
 
387 aa  328  7e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 
377 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
378 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  27.52 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
390 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  30.66 
 
 
350 aa  109  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 
386 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
401 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
370 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
439 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  32.84 
 
 
372 aa  106  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
399 aa  106  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.35 
 
 
365 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
395 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
367 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.44 
 
 
745 aa  102  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 
384 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
383 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
367 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
369 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.65 
 
 
359 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
369 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
370 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
385 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
381 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 
403 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  36.5 
 
 
377 aa  99.8  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  23.84 
 
 
374 aa  99.8  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
362 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.06 
 
 
419 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
389 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
387 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
384 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 
371 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 
388 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
370 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
373 aa  97.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  32.68 
 
 
350 aa  97.1  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
392 aa  96.7  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3115  group 1 glycosyl transferase  28.57 
 
 
374 aa  96.7  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
367 aa  96.3  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  27.84 
 
 
353 aa  96.7  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
401 aa  95.9  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 
704 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
390 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 
380 aa  94  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
414 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 
440 aa  94  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
383 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
364 aa  93.2  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
1080 aa  92.8  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 
440 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
364 aa  91.3  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  23.94 
 
 
745 aa  91.3  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  26.69 
 
 
371 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
388 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  20.83 
 
 
375 aa  91.3  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  35.82 
 
 
362 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
396 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
360 aa  90.5  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  38.06 
 
 
358 aa  90.5  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
379 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
350 aa  90.1  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  23.82 
 
 
366 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
391 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 
367 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  24.41 
 
 
371 aa  89.7  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
398 aa  89.7  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
364 aa  89.4  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
374 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  24.08 
 
 
366 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
371 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  23.22 
 
 
369 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 
379 aa  89.4  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
376 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
398 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.82 
 
 
366 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 
361 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  31.84 
 
 
385 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  27.24 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
419 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  23.82 
 
 
366 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
385 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 
890 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>