More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2548 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 367 aa  724    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  87.96 
 
 		 362 aa  628  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  54.35 
 
 		 385 aa  388  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  47.15 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  41.22 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  40.79 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  39.21 
 
 		 376 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  39.89 
 
 		 404 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 		 377 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  39.79 
 
 		 381 aa  236  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  39.52 
 
 		 381 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  34.59 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  38.29 
 
 		 379 aa  222  9e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.56 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  35.05 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0540  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.22 
 
 		 369 aa  212  7.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180191  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 		 377 aa  205  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  37.3 
 
 		 382 aa  202  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 385 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  35.98 
 
 		 377 aa  192  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  38.67 
 
 		 376 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  38.59 
 
 		 638 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  36.29 
 
 		 613 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  35.77 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2891  glycosyl transferase group 1  29.16 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0495  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 383 aa  151  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 369 aa  133  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  34.55 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  37.38 
 
 		 374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  33.86 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  34.17 
 
 		 410 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  27.27 
 
 		 423 aa  119  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  38.16 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  40.95 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 360 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 		 371 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 		 381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  41.75 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  33.61 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.15 
 
 		 409 aa  113  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 453 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 		 380 aa  113  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  43.09 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.16 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  40.31 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  27.95 
 
 		 364 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1772  group 1 glycosyl transferase  30.16 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 		 424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.19 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  38.42 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  31.3 
 
 		 414 aa  109  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 412 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  40.94 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2374  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 412 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 412 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 		 408 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  38.42 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  37.45 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 		 417 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1064  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 		 400 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  32.51 
 
 		 468 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 402 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 		 425 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5198  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.603506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  41.72 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  33.96 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  37.44 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 		 386 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  34.69 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>