More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2777 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 382 aa  772    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  50.27 
 
 		 376 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  43.84 
 
 		 638 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  37.3 
 
 		 367 aa  202  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  36.83 
 
 		 362 aa  199  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  36.14 
 
 		 385 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  34.56 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 370 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2891  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 		 369 aa  163  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  32.39 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 376 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0495  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 		 371 aa  150  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0540  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.52 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  28.72 
 
 		 381 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  28.76 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 367 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 		 379 aa  133  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  25.61 
 
 		 370 aa  119  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  34.96 
 
 		 415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  29.16 
 
 		 613 aa  113  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 		 377 aa  111  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 422 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  36 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 419 aa  97.4  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 		 411 aa  97.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.74 
 
 		 423 aa  97.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  38.95 
 
 		 370 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 402 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  34.08 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  33.9 
 
 		 379 aa  94.4  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 426 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 419 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 446 aa  94.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 		 413 aa  93.6  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 423 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.66 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 392 aa  90.9  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 		 390 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 		 364 aa  89.7  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 		 904 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  37.74 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2188  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.777169 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.17 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 381 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 		 453 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  35.76 
 
 		 353 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  33.02 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 		 406 aa  86.7  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 406 aa  86.7  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 412 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 		 367 aa  86.7  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 		 366 aa  86.7  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 		 369 aa  86.7  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 410 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  34.43 
 
 		 397 aa  86.3  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  30.8 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2374  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 		 458 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3845  group 1 glycosyl transferase  27.92 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1365  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0228  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  35.36 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  38.34 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.27 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>