More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0228 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0228  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 407 aa  827    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  29.26 
 
 		 417 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4272  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 		 428 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.553747  normal  0.320513 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.05 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2188  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 		 418 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.777169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  35.78 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 		 360 aa  97.4  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1702  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 		 406 aa  92.8  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2630  glycosyl transferase group 1  40.74 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 		 419 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  33.97 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  29.02 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  40.68 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3655  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  36.97 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  33.18 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2505  glycosyl transferase, group 1  34.73 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  34.6 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 		 871 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  30.48 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  37.85 
 
 		 739 aa  80.1  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  36.44 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  36.41 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  36 
 
 		 404 aa  79.7  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  35.95 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  40.54 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.05 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  46.23 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 536 aa  75.5  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  34.03 
 
 		 343 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 409 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4365  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.893788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  36.3 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  36.14 
 
 		 638 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.62 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2801  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  39.82 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  36.25 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0254  glycosyl transferase group 1  36.52 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.401969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  36.02 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.71 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  32.29 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  27.05 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  33.72 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  30.12 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  38.32 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  28.73 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 377 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 		 356 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>