More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0254 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0254  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
389 aa  806    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.401969  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2585  glycosyl transferase group 1  40.21 
 
 
388 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  0.530057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5134  glycosyl transferase group 1  34.61 
 
 
386 aa  239  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5790  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
376 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
380 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
380 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  28.53 
 
 
398 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0869  a-glycosyltransferase  32.97 
 
 
358 aa  139  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746857  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
377 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13791  hypothetical protein  31.44 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6700  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 
396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5854  putative glycosyl transferase  26.32 
 
 
381 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707632  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3338  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.620464  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.77 
 
 
385 aa  110  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
378 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2088  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 
347 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3905  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
366 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.840872  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2801  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
393 aa  106  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
405 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2753  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
388 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.580745  normal  0.199234 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
351 aa  100  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
413 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  40.26 
 
 
353 aa  96.3  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  24.67 
 
 
376 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0557  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
399 aa  94.4  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  24.19 
 
 
769 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
394 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
390 aa  93.6  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  35.19 
 
 
389 aa  93.6  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
360 aa  92.8  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  38.06 
 
 
803 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  35.59 
 
 
397 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1686  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 
359 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
387 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  38.16 
 
 
374 aa  89.7  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  32.43 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
743 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  28.52 
 
 
392 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
404 aa  87  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  29.25 
 
 
402 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 
871 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  26.9 
 
 
426 aa  86.3  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
398 aa  86.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1345  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.69 
 
 
373 aa  86.3  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  32.34 
 
 
935 aa  86.3  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  37.24 
 
 
461 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  33.66 
 
 
476 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2420  glycosyl transferase, group 1  33.11 
 
 
400 aa  84.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.959813 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4918  group 1 glycosyl transferase  33.73 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
426 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  36.15 
 
 
406 aa  84  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  36.43 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  37.29 
 
 
424 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0727  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0832639  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3243  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0322741  normal  0.0997913 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  25.94 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  26.91 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 
446 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1365  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2857  group 1 glycosyl transferase  27.2 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  24.37 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 
426 aa  80.9  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
660 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  29.08 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  39.67 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.29 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  30.65 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  33.33 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2630  glycosyl transferase group 1  36.5 
 
 
438 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451665  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 
390 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 
390 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 
819 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
827 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  32.74 
 
 
374 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
399 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>