More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0557 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0557  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
399 aa  821    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3905  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.840872  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4918  group 1 glycosyl transferase  30.86 
 
 
366 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1293  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
410 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0254  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.401969  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13791  hypothetical protein  25.55 
 
 
389 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2420  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 
400 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.959813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3338  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
415 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.620464  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2585  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
388 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  0.530057 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5790  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
376 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2753  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.580745  normal  0.199234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
405 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0869  a-glycosyltransferase  29.89 
 
 
358 aa  87.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746857  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1686  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 
359 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5134  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
351 aa  84  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  29.15 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  34 
 
 
417 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5225  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6700  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
396 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 
419 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2088  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
347 aa  79.3  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 
812 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 
819 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  36.62 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4717  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
893 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.337059  normal  0.0164521 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  32.19 
 
 
803 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
446 aa  73.2  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  34.55 
 
 
402 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  35.26 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  33.89 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  35.97 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  31.01 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  27.72 
 
 
816 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.21 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1722  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.664722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  34.56 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
397 aa  67  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3401  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  37.59 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
390 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  36.76 
 
 
418 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 
871 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  33.12 
 
 
388 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
416 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5854  putative glycosyl transferase  22.58 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707632  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  38.69 
 
 
402 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  31.54 
 
 
366 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  33.33 
 
 
426 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  32.21 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
389 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  35.92 
 
 
411 aa  64.3  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
396 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 
398 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 
772 aa  63.9  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  23.47 
 
 
382 aa  64.3  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4938  glycosyl transferase, putative  30.19 
 
 
379 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.54 
 
 
366 aa  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
369 aa  63.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
385 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
816 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
385 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  33.56 
 
 
358 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  34.31 
 
 
368 aa  63.5  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0215  glycosyltransferase  23.81 
 
 
379 aa  63.5  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
394 aa  63.5  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  36.88 
 
 
347 aa  63.5  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1345  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.25 
 
 
373 aa  63.2  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  34.19 
 
 
414 aa  63.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
388 aa  63.5  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  34.06 
 
 
392 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4956  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
340 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>