More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1303 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
408 aa  842    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  59.9 
 
 
395 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  52.91 
 
 
446 aa  432  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  52.41 
 
 
410 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  50.5 
 
 
413 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  53 
 
 
397 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  52.02 
 
 
417 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  48.61 
 
 
419 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  47.74 
 
 
415 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  48.38 
 
 
395 aa  349  5e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  47.87 
 
 
396 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  48.26 
 
 
395 aa  341  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  46 
 
 
395 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  42.93 
 
 
536 aa  334  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  46.42 
 
 
396 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  46.42 
 
 
396 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  43.11 
 
 
399 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  45.36 
 
 
396 aa  327  3e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  43.81 
 
 
402 aa  318  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  43.32 
 
 
414 aa  317  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  44.14 
 
 
414 aa  307  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  40.95 
 
 
390 aa  288  1e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  42.75 
 
 
935 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  39.7 
 
 
387 aa  281  2e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  39.49 
 
 
396 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  40.77 
 
 
353 aa  260  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  37.97 
 
 
391 aa  258  9e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  41.67 
 
 
438 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  38.74 
 
 
464 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  38.3 
 
 
414 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  37.09 
 
 
398 aa  250  4e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
391 aa  246  6e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  36.71 
 
 
417 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  37.37 
 
 
417 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  36.9 
 
 
410 aa  226  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  36.02 
 
 
414 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  36.22 
 
 
410 aa  216  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  34.14 
 
 
435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  35.77 
 
 
412 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  35.77 
 
 
412 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  35.77 
 
 
412 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  32.5 
 
 
393 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  32.91 
 
 
384 aa  187  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 
389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 
379 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  31.16 
 
 
395 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 
537 aa  179  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 
379 aa  179  8e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 
384 aa  173  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  30.5 
 
 
388 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
429 aa  169  8e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 
379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
398 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  29.16 
 
 
407 aa  151  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  27.95 
 
 
404 aa  149  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  28.34 
 
 
416 aa  145  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
456 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 
413 aa  144  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  29.34 
 
 
406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  26.14 
 
 
406 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
436 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  28.65 
 
 
426 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 
382 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  27.32 
 
 
404 aa  134  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  27.95 
 
 
396 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 
369 aa  133  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
421 aa  133  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
377 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
399 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.06 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1869  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.740215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  27.98 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 
375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
439 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
439 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
373 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
422 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  26.04 
 
 
431 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  26.08 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  32.35 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  23.96 
 
 
427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  25.48 
 
 
397 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
748 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
415 aa  126  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
434 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  24.94 
 
 
404 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
438 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  26.51 
 
 
404 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>