More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1032 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
384 aa  797    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  58.82 
 
 
379 aa  464  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  58.36 
 
 
379 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  55.82 
 
 
390 aa  429  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  53.03 
 
 
379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  48.79 
 
 
379 aa  381  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  43.19 
 
 
384 aa  286  4e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  42.42 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  41.41 
 
 
395 aa  278  8e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  40.1 
 
 
387 aa  278  9e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  39.49 
 
 
537 aa  271  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  39.49 
 
 
389 aa  267  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
419 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 
390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 
408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
415 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
446 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
391 aa  162  7e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
413 aa  156  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
396 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  32.91 
 
 
935 aa  150  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
410 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
536 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
417 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
396 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
396 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
414 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 
414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 
395 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  30.05 
 
 
417 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  27.71 
 
 
395 aa  130  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
413 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 
414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.33 
 
 
388 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
425 aa  123  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 
396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  29.05 
 
 
398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
402 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
417 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
410 aa  116  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  26.55 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  31.45 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  27.27 
 
 
423 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  31.53 
 
 
396 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 
430 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  30.6 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  31.76 
 
 
386 aa  109  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
353 aa  109  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
394 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  28.34 
 
 
404 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  28.36 
 
 
414 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
456 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  31.83 
 
 
411 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
379 aa  106  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  25.47 
 
 
404 aa  106  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  28.93 
 
 
404 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
410 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 
412 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 
412 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  30.62 
 
 
412 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  29.02 
 
 
406 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 
373 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 
756 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  28.61 
 
 
401 aa  102  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
378 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  35.96 
 
 
388 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  28.89 
 
 
428 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
424 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  29.41 
 
 
416 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  30.23 
 
 
384 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  32.04 
 
 
395 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
438 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  29.83 
 
 
394 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
407 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  39.66 
 
 
372 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
381 aa  99.4  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
422 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
425 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
381 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  29.35 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.36 
 
 
420 aa  97.8  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
434 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  31.49 
 
 
395 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  28.35 
 
 
404 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  29.57 
 
 
429 aa  97.8  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
435 aa  97.8  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  27.27 
 
 
397 aa  97.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
453 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
430 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>