More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6058 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 417 aa  813    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  70.67 
 
 		 417 aa  543  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  59.43 
 
 		 425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  59.7 
 
 		 410 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  58.62 
 
 		 414 aa  433  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  60.19 
 
 		 412 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  60.19 
 
 		 412 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  60.19 
 
 		 412 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  59.66 
 
 		 410 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  55.19 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  48.62 
 
 		 464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  48.97 
 
 		 438 aa  310  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  44.17 
 
 		 414 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  36.72 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  40.59 
 
 		 446 aa  265  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  37.37 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  39.56 
 
 		 935 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  33.58 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  38.17 
 
 		 413 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 536 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 		 419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  40.1 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 		 391 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  40.45 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  37.78 
 
 		 414 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  37.44 
 
 		 396 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  37.44 
 
 		 396 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 		 387 aa  228  1e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  39 
 
 		 414 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  36.52 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  37.28 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 		 398 aa  221  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 		 397 aa  219  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  40.72 
 
 		 353 aa  219  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 391 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 		 391 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 		 395 aa  216  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  34.64 
 
 		 395 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  39.07 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 399 aa  189  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  31.57 
 
 		 407 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 		 379 aa  156  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 		 379 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 		 379 aa  153  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 		 390 aa  152  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  31.6 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 		 379 aa  150  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  28.9 
 
 		 404 aa  149  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 		 537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 		 389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.67 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  27.1 
 
 		 395 aa  137  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 384 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  28.04 
 
 		 393 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  28.19 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.31 
 
 		 396 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.05 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  27.93 
 
 		 404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  33.81 
 
 		 395 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  30.21 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  32.11 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  29.45 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 		 373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  29.26 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  36.19 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  28.34 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  33.57 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  27.29 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  30.81 
 
 		 382 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 421 aa  124  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 423 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 		 367 aa  123  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  24.37 
 
 		 383 aa  122  9e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  32.47 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  27.23 
 
 		 388 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 		 415 aa  120  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  29.04 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  32.7 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  31.23 
 
 		 387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  31.84 
 
 		 403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  31.18 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  27.16 
 
 		 650 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 422 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  34.55 
 
 		 411 aa  113  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 410 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>