More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3232 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
464 aa  914    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  70.21 
 
 
438 aa  570  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  51.76 
 
 
414 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  48.48 
 
 
417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  45.08 
 
 
425 aa  310  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  36.75 
 
 
536 aa  299  6e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  43.9 
 
 
414 aa  296  6e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  43.35 
 
 
410 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  45.15 
 
 
415 aa  294  3e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  41.03 
 
 
435 aa  294  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  47.99 
 
 
417 aa  290  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  37.72 
 
 
395 aa  290  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  45.2 
 
 
412 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  45.2 
 
 
412 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  45.2 
 
 
412 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  41.16 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  39.7 
 
 
417 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  36.9 
 
 
410 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  38.74 
 
 
408 aa  277  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  43.2 
 
 
410 aa  276  7e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  37.82 
 
 
419 aa  273  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  41.42 
 
 
935 aa  271  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  40.36 
 
 
413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  40.72 
 
 
396 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 
397 aa  256  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 
390 aa  249  6e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  35.81 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  35.81 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  37.76 
 
 
387 aa  242  7.999999999999999e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  35.35 
 
 
395 aa  239  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  36.83 
 
 
396 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 
395 aa  236  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  37.66 
 
 
414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
391 aa  232  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  38.28 
 
 
414 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 
399 aa  229  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 
396 aa  227  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  40.05 
 
 
402 aa  222  9e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 
391 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
398 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  33.75 
 
 
395 aa  220  3.9999999999999997e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  40.11 
 
 
353 aa  220  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
391 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 
413 aa  160  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
407 aa  158  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  29.28 
 
 
393 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  27.11 
 
 
388 aa  154  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  28.4 
 
 
395 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  27.72 
 
 
384 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 
373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 
369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
379 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
389 aa  145  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
379 aa  143  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
390 aa  142  9e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
537 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  33.17 
 
 
406 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  23.64 
 
 
429 aa  136  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 
429 aa  135  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  29.31 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  30.94 
 
 
397 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  29.59 
 
 
398 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
419 aa  133  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  31.9 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.83 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.23 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  24.83 
 
 
404 aa  131  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
379 aa  130  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  33.66 
 
 
405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
434 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
385 aa  128  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  30.59 
 
 
417 aa  127  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 
379 aa  126  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
374 aa  126  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  31.78 
 
 
403 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  35.18 
 
 
402 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 
348 aa  125  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 
416 aa  124  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
396 aa  123  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  29.48 
 
 
438 aa  123  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0088  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
369 aa  123  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.323047  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  29.37 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  29.76 
 
 
401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  30.27 
 
 
398 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
378 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
421 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  29.87 
 
 
431 aa  120  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
422 aa  120  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  29.9 
 
 
458 aa  120  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
435 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 
422 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>