More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0627 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  100 
 
 
438 aa  868    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  68.54 
 
 
458 aa  552  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  68.8 
 
 
439 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  68.97 
 
 
439 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  68.97 
 
 
439 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  64.33 
 
 
450 aa  525  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  65.14 
 
 
442 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  64.98 
 
 
480 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  61.76 
 
 
431 aa  505  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  62.38 
 
 
417 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  61.88 
 
 
466 aa  485  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  60.1 
 
 
443 aa  472  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  59.38 
 
 
448 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  60.98 
 
 
427 aa  470  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  61.69 
 
 
450 aa  461  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  59.37 
 
 
431 aa  461  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  59.18 
 
 
482 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  59.31 
 
 
428 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  56.5 
 
 
448 aa  451  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  57.79 
 
 
458 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  57.39 
 
 
434 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  57.18 
 
 
435 aa  431  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  55.23 
 
 
434 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  57.7 
 
 
435 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  55.37 
 
 
435 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  52.68 
 
 
424 aa  398  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  54.81 
 
 
417 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4336  UDP-N-acetylglucosamine  52.35 
 
 
429 aa  388  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  53.37 
 
 
420 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  51.8 
 
 
443 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  50.86 
 
 
418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  46.06 
 
 
420 aa  339  5e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  46.8 
 
 
421 aa  339  5e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  40.48 
 
 
423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  37.53 
 
 
419 aa  266  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  38.92 
 
 
426 aa  252  8.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  40.14 
 
 
421 aa  250  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  42.62 
 
 
413 aa  230  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  38.65 
 
 
421 aa  226  9e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.45 
 
 
405 aa  224  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  40.43 
 
 
1169 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  38.15 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  36.65 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  33.74 
 
 
405 aa  206  9e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
434 aa  204  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  35.18 
 
 
453 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 
438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 
672 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
439 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
439 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
439 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
419 aa  193  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
438 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.15 
 
 
495 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.15 
 
 
499 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 
405 aa  191  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.15 
 
 
498 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.24 
 
 
443 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.24 
 
 
443 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
440 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.24 
 
 
443 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.24 
 
 
443 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 
437 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  35.83 
 
 
437 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 
438 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
422 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  31.19 
 
 
423 aa  186  6e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
435 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  35.01 
 
 
442 aa  184  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  32.63 
 
 
426 aa  183  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
426 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  35.32 
 
 
422 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  35.99 
 
 
415 aa  180  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  35.87 
 
 
406 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 
650 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
424 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  36.39 
 
 
405 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
477 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
430 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  35.18 
 
 
402 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  32.11 
 
 
403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  35.41 
 
 
406 aa  163  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  35.05 
 
 
397 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 
420 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  34.86 
 
 
407 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1278  glycosyl transferase, group 1  32.7 
 
 
408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1295  glycosyl transferase, group 1  32.7 
 
 
408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675113  normal  0.124079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1307  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 
408 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
410 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  30.58 
 
 
413 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  30.19 
 
 
392 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 
408 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
391 aa  120  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>