More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1002 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
405 aa  837    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  80.45 
 
 
405 aa  685    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  84.2 
 
 
405 aa  719    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 
419 aa  280  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  39.75 
 
 
423 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  37.89 
 
 
426 aa  273  6e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  38.7 
 
 
421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  35.91 
 
 
422 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  38.22 
 
 
421 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  37.71 
 
 
434 aa  253  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  39.75 
 
 
427 aa  252  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  37.28 
 
 
450 aa  250  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  38.38 
 
 
417 aa  249  6e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  37.9 
 
 
448 aa  246  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  38.77 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  37.4 
 
 
450 aa  244  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4336  UDP-N-acetylglucosamine  37.47 
 
 
429 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  38.14 
 
 
439 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.28 
 
 
435 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 
672 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  37.07 
 
 
431 aa  239  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  38.73 
 
 
434 aa  238  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  34.54 
 
 
440 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
435 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  34.22 
 
 
419 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  40 
 
 
417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  37.72 
 
 
435 aa  234  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 
425 aa  233  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  35.89 
 
 
420 aa  232  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  38.93 
 
 
466 aa  232  8.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  38.71 
 
 
421 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 
442 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
422 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  38.4 
 
 
439 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  38.4 
 
 
439 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  35.78 
 
 
480 aa  227  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
424 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  36.67 
 
 
431 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  35.45 
 
 
438 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  36.71 
 
 
420 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  33.41 
 
 
650 aa  224  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  36.67 
 
 
458 aa  224  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.66 
 
 
443 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.66 
 
 
443 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.66 
 
 
443 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.66 
 
 
443 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.66 
 
 
499 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.66 
 
 
495 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.66 
 
 
498 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  34.24 
 
 
418 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  36.39 
 
 
443 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  35.52 
 
 
477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  34.73 
 
 
442 aa  219  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
439 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
437 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
437 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 
430 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
439 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
439 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  33.25 
 
 
423 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  39.53 
 
 
435 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  35.94 
 
 
482 aa  216  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  33.11 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  32.67 
 
 
426 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  34.24 
 
 
438 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
434 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
448 aa  213  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 
438 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
438 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  34.95 
 
 
458 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  33.09 
 
 
411 aa  209  7e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  33.01 
 
 
424 aa  209  8e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  32.58 
 
 
406 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  34.25 
 
 
405 aa  206  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
420 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 
415 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  32.91 
 
 
397 aa  193  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
402 aa  193  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 
406 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 
422 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 
418 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  31.11 
 
 
403 aa  176  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1307  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 
408 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  31.85 
 
 
407 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1278  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 
408 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1295  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 
408 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675113  normal  0.124079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
448 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
405 aa  163  6e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  29.24 
 
 
413 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  29.48 
 
 
1169 aa  146  6e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  32.5 
 
 
413 aa  146  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0533  sucrose synthase  29.52 
 
 
423 aa  143  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  28.79 
 
 
392 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
391 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1891  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120755  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0808  HAD family hydrolase  28.26 
 
 
709 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  36.67 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>