More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0989 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  100 
 
 
458 aa  917    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  68.54 
 
 
438 aa  552  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  67.14 
 
 
439 aa  554  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  67.61 
 
 
450 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  67.38 
 
 
439 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  67.38 
 
 
439 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  66.83 
 
 
480 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  68.11 
 
 
442 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  63.66 
 
 
417 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  62.04 
 
 
431 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  62.56 
 
 
427 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  59.95 
 
 
448 aa  485  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  59.48 
 
 
482 aa  478  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  58.92 
 
 
443 aa  474  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  60.7 
 
 
450 aa  468  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  59.85 
 
 
466 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  57.11 
 
 
428 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  56.12 
 
 
431 aa  448  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  57.39 
 
 
434 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  56.24 
 
 
448 aa  442  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  58.91 
 
 
435 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  56.02 
 
 
435 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  55.83 
 
 
458 aa  435  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  54.29 
 
 
424 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  54.03 
 
 
434 aa  421  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  54.07 
 
 
420 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  54.67 
 
 
417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  54.66 
 
 
435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4336  UDP-N-acetylglucosamine  54.57 
 
 
429 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  52.33 
 
 
443 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  48.9 
 
 
420 aa  355  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  48.2 
 
 
418 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  49.03 
 
 
421 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  40.62 
 
 
421 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  39.7 
 
 
423 aa  250  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  36.3 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  37.72 
 
 
426 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  38.7 
 
 
421 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.67 
 
 
405 aa  223  4e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  36.03 
 
 
438 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  36.16 
 
 
405 aa  216  5e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 
672 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  37.11 
 
 
405 aa  209  9e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 
439 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 
438 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  35.05 
 
 
439 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
438 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  35.05 
 
 
439 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  35.82 
 
 
453 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  38.9 
 
 
413 aa  206  7e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  39.43 
 
 
1169 aa  206  8e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  32.39 
 
 
423 aa  206  8e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 
419 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  35.31 
 
 
411 aa  200  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
434 aa  199  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 
422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.11 
 
 
443 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.11 
 
 
495 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
422 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.11 
 
 
499 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.11 
 
 
443 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.11 
 
 
443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.11 
 
 
498 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.11 
 
 
443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  35.35 
 
 
442 aa  194  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  36.08 
 
 
405 aa  193  4e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
440 aa  193  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 
426 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  33.61 
 
 
435 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  31.89 
 
 
650 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
424 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  32.4 
 
 
426 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
430 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  35.49 
 
 
415 aa  170  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
437 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
437 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
477 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
422 aa  162  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
405 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  35.83 
 
 
397 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  34.21 
 
 
406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  32.77 
 
 
403 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 
420 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 
418 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1278  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1295  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675113  normal  0.124079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1307  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
448 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  34.26 
 
 
407 aa  123  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  28.99 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
393 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.11 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
395 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 
408 aa  113  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  29.51 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.06 
 
 
401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
390 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>