More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0295 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  828    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5208  glycosyl transferase group 1  53.79 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  normal  0.673241 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  43.32 
 
 
403 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  40.15 
 
 
393 aa  253  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  38.98 
 
 
406 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  38.9 
 
 
405 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1307  glycosyl transferase, group 1  41.19 
 
 
408 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  38.61 
 
 
420 aa  246  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  40.05 
 
 
418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  39.31 
 
 
415 aa  239  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1278  glycosyl transferase, group 1  40.45 
 
 
408 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1295  glycosyl transferase, group 1  40.45 
 
 
408 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675113  normal  0.124079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  37.56 
 
 
407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1891  glycosyl transferase group 1  40.63 
 
 
415 aa  233  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120755  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  38.69 
 
 
402 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  35.66 
 
 
392 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3722  glycosyl transferase, group 1  39.11 
 
 
400 aa  223  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  37.35 
 
 
422 aa  221  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  39.05 
 
 
406 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  39.36 
 
 
397 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  37.81 
 
 
400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1891  glycosyl transferase group 1  39.55 
 
 
382 aa  209  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2803  glycosyl transferase group 1  37.84 
 
 
387 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129737  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1513  group 1 glycosyl transferase  38.21 
 
 
349 aa  196  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42388  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
419 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
435 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
672 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
439 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
439 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
439 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
438 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.86 
 
 
443 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.86 
 
 
443 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.86 
 
 
499 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.86 
 
 
495 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 
440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.62 
 
 
443 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.62 
 
 
443 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.62 
 
 
498 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
438 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
438 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
405 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
405 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
430 aa  156  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.24 
 
 
405 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3205  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 
381 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  30.02 
 
 
442 aa  146  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
434 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
422 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3449  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
409 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.455826  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
419 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  26 
 
 
650 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
453 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  29.83 
 
 
420 aa  133  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  30.94 
 
 
480 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
439 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  30.41 
 
 
411 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  29.44 
 
 
443 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
477 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
439 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
439 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  30.58 
 
 
438 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  28.54 
 
 
427 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
442 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 
450 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  30.05 
 
 
418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  30.17 
 
 
450 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 
448 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  28.43 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4336  UDP-N-acetylglucosamine  28.04 
 
 
429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  28.95 
 
 
420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
414 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  29.07 
 
 
434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  23.56 
 
 
423 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  29.78 
 
 
417 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  28.57 
 
 
466 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
448 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  29.06 
 
 
431 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 
425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.43 
 
 
401 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
536 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  29.23 
 
 
428 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
390 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
421 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  26.79 
 
 
421 aa  106  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
482 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
408 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.68 
 
 
360 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
452 aa  103  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  29.14 
 
 
417 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>