More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02650 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  100 
 
 
431 aa  852    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  72.99 
 
 
417 aa  588  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  65.18 
 
 
482 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  64 
 
 
448 aa  521  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  62.04 
 
 
458 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  65.53 
 
 
439 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  64.49 
 
 
480 aa  513  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  63.59 
 
 
427 aa  512  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  63.73 
 
 
443 aa  508  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  67.08 
 
 
450 aa  508  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  61.76 
 
 
438 aa  505  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  65.4 
 
 
450 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  65.78 
 
 
439 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  65.78 
 
 
439 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  63.18 
 
 
428 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  61.2 
 
 
435 aa  488  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  65.08 
 
 
442 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  62.35 
 
 
458 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  61.34 
 
 
431 aa  482  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  63.05 
 
 
466 aa  474  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  58.18 
 
 
448 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  60.47 
 
 
435 aa  462  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  59.71 
 
 
434 aa  461  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  56.94 
 
 
434 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  60.49 
 
 
435 aa  444  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4336  UDP-N-acetylglucosamine  58.19 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  54.63 
 
 
424 aa  420  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  57.76 
 
 
420 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  56.69 
 
 
417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  54.27 
 
 
443 aa  397  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  52.15 
 
 
418 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  49.27 
 
 
421 aa  350  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  48.4 
 
 
420 aa  341  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  43.2 
 
 
421 aa  290  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  40.93 
 
 
423 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  42.13 
 
 
426 aa  276  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  37.59 
 
 
419 aa  264  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  42.48 
 
 
421 aa  263  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.07 
 
 
405 aa  239  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  42.55 
 
 
413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  36.39 
 
 
405 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  37.06 
 
 
405 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  39.95 
 
 
1169 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  36.63 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
438 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  34.63 
 
 
426 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
425 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
672 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  35.49 
 
 
419 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 
439 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  35.02 
 
 
422 aa  202  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 
438 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
439 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 
439 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
422 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  32.85 
 
 
423 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.87 
 
 
495 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.87 
 
 
499 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.87 
 
 
498 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  33.5 
 
 
426 aa  190  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.72 
 
 
443 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
440 aa  189  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.72 
 
 
443 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.72 
 
 
443 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.72 
 
 
443 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  34.39 
 
 
442 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 
424 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
437 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
437 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  36.97 
 
 
405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
435 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
430 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
477 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  36.14 
 
 
422 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  29.93 
 
 
650 aa  172  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  34.83 
 
 
415 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  35.87 
 
 
405 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  33.9 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  34.45 
 
 
403 aa  163  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
420 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
402 aa  156  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  33.17 
 
 
397 aa  154  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
406 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  35.08 
 
 
418 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
393 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1278  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
408 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1295  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
408 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675113  normal  0.124079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1307  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
408 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3722  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
400 aa  127  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
395 aa  126  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  31.5 
 
 
407 aa  122  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
400 aa  119  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 
386 aa  117  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1891  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>