More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4408 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
393 aa  756    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  54.52 
 
 
403 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  54.03 
 
 
405 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1278  glycosyl transferase, group 1  52.59 
 
 
408 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1295  glycosyl transferase, group 1  52.59 
 
 
408 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675113  normal  0.124079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1307  glycosyl transferase, group 1  51.81 
 
 
408 aa  330  4e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  50.52 
 
 
406 aa  328  8e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  53.91 
 
 
418 aa  322  7e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  50.39 
 
 
402 aa  319  7e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  48.48 
 
 
422 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  50.25 
 
 
415 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  50.9 
 
 
406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  49.48 
 
 
420 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  50 
 
 
397 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1891  glycosyl transferase group 1  51.68 
 
 
382 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  47.78 
 
 
407 aa  276  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2803  glycosyl transferase group 1  46.67 
 
 
387 aa  269  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129737  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  40.15 
 
 
413 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3722  glycosyl transferase, group 1  43.85 
 
 
400 aa  250  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  44.1 
 
 
400 aa  249  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  41.3 
 
 
392 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1891  glycosyl transferase group 1  43.73 
 
 
415 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120755  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5208  glycosyl transferase group 1  40.55 
 
 
425 aa  240  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  normal  0.673241 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  38.7 
 
 
439 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  38.7 
 
 
439 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  38.22 
 
 
439 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  38.6 
 
 
438 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  39.01 
 
 
437 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  39.01 
 
 
437 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  39.36 
 
 
419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1513  group 1 glycosyl transferase  43.14 
 
 
349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42388  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  38.6 
 
 
438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  38.6 
 
 
438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 
440 aa  219  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  36.95 
 
 
442 aa  212  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 
435 aa  212  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  38.86 
 
 
430 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.92 
 
 
443 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.92 
 
 
443 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.92 
 
 
498 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.83 
 
 
499 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.83 
 
 
495 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.83 
 
 
443 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 
672 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.83 
 
 
443 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  33.25 
 
 
650 aa  202  8e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3449  glycosyl transferase, group 1  38.31 
 
 
409 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.455826  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
434 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
419 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 
477 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3205  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 
381 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.98 
 
 
405 aa  169  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  33.33 
 
 
424 aa  163  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  35.77 
 
 
442 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
405 aa  160  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  36.23 
 
 
420 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  37.84 
 
 
417 aa  157  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
421 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.18 
 
 
423 aa  153  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  34.48 
 
 
427 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
482 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  36.24 
 
 
448 aa  150  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  33.75 
 
 
411 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
426 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  31.85 
 
 
443 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4336  UDP-N-acetylglucosamine  32.76 
 
 
429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 
450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  33.09 
 
 
431 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  32.92 
 
 
480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  34.24 
 
 
428 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
425 aa  145  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 
421 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
424 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  33.83 
 
 
466 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
426 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 
439 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 
439 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  34.37 
 
 
435 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  35.63 
 
 
417 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 
439 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  31.51 
 
 
438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
448 aa  140  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  36.26 
 
 
443 aa  139  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 
458 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  33.59 
 
 
450 aa  135  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  32.83 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  32.52 
 
 
431 aa  133  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
425 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 
410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.88 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  35.89 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  32.58 
 
 
418 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
421 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  31.53 
 
 
458 aa  126  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
412 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>