More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5593 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
440 aa  910    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  56.27 
 
 
422 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  56.76 
 
 
672 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  53.77 
 
 
650 aa  450  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  52.77 
 
 
419 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  53.3 
 
 
442 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  52.96 
 
 
430 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  52.66 
 
 
438 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  52.29 
 
 
438 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  51.79 
 
 
435 aa  433  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  52.29 
 
 
438 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  51.57 
 
 
439 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  51.57 
 
 
439 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  51.57 
 
 
439 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  52.58 
 
 
498 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  52.33 
 
 
443 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  52.58 
 
 
443 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  52.33 
 
 
499 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  52.33 
 
 
443 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  52.58 
 
 
443 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  52.33 
 
 
495 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  49.39 
 
 
437 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  49.39 
 
 
437 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  44.88 
 
 
434 aa  373  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  41.87 
 
 
422 aa  302  8.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  44.74 
 
 
415 aa  299  8e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  41.75 
 
 
405 aa  295  8e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 
453 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 
426 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  40.59 
 
 
406 aa  285  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  41.83 
 
 
403 aa  284  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  36.86 
 
 
423 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  39.41 
 
 
420 aa  277  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  43.53 
 
 
406 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  40.39 
 
 
402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 
419 aa  264  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  39.12 
 
 
418 aa  263  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  39.05 
 
 
477 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1278  glycosyl transferase, group 1  39.23 
 
 
408 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1295  glycosyl transferase, group 1  39.23 
 
 
408 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675113  normal  0.124079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 
426 aa  257  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1307  glycosyl transferase, group 1  38.5 
 
 
408 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  34.3 
 
 
422 aa  252  9.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 
424 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  34.52 
 
 
423 aa  250  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
425 aa  249  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.54 
 
 
405 aa  238  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  37.87 
 
 
397 aa  235  9e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  34.8 
 
 
405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  36.84 
 
 
407 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  36.15 
 
 
448 aa  230  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  34.87 
 
 
427 aa  229  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  34.87 
 
 
405 aa  227  4e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 
421 aa  227  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  35.28 
 
 
428 aa  225  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  31.37 
 
 
426 aa  223  4.9999999999999996e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  35.97 
 
 
421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  36.59 
 
 
417 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  36.87 
 
 
418 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
482 aa  216  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  32.21 
 
 
420 aa  216  8e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  34.34 
 
 
450 aa  210  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  34.48 
 
 
466 aa  209  7e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 
393 aa  209  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 
448 aa  209  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  32.92 
 
 
443 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 
435 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  34.06 
 
 
431 aa  206  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.09 
 
 
435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  31.58 
 
 
417 aa  200  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  32.58 
 
 
420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 
458 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  32.21 
 
 
443 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  32.83 
 
 
434 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  30.83 
 
 
424 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 
421 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  33.5 
 
 
458 aa  193  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 
435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 
434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  32.49 
 
 
431 aa  189  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  32.54 
 
 
438 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4336  UDP-N-acetylglucosamine  32.44 
 
 
429 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
448 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
439 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 
439 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  30.62 
 
 
411 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  30.84 
 
 
480 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1891  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
415 aa  166  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120755  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  29.85 
 
 
413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
400 aa  159  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  29.88 
 
 
392 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
405 aa  155  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5208  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
425 aa  153  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  normal  0.673241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3722  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
400 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  32.5 
 
 
406 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
390 aa  145  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
391 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>