More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5045 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
422 aa  866    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  57.28 
 
 
650 aa  476  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  56.27 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  55.91 
 
 
672 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  50.25 
 
 
419 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  51.36 
 
 
430 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  50.12 
 
 
442 aa  420  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  52.08 
 
 
435 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.51 
 
 
443 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.51 
 
 
443 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.51 
 
 
498 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.26 
 
 
443 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.26 
 
 
499 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.26 
 
 
443 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.26 
 
 
495 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  48.33 
 
 
438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  47.14 
 
 
439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  48.58 
 
 
437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  48.33 
 
 
438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  47.14 
 
 
439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  48.58 
 
 
437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  47.14 
 
 
439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  48.52 
 
 
438 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  46.21 
 
 
434 aa  375  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 
423 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  37.28 
 
 
453 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  39.33 
 
 
406 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  40.63 
 
 
422 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  35.89 
 
 
426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  39.76 
 
 
406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 
426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  38.59 
 
 
402 aa  281  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  41.36 
 
 
415 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  39.21 
 
 
405 aa  279  9e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  39.7 
 
 
418 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 
422 aa  272  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  39.14 
 
 
403 aa  269  5.9999999999999995e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  36.98 
 
 
421 aa  269  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.91 
 
 
405 aa  267  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  38.5 
 
 
420 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
425 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  33.33 
 
 
423 aa  263  4e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  39.95 
 
 
397 aa  262  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  34.89 
 
 
419 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
405 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 
421 aa  260  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 
424 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  35.16 
 
 
405 aa  257  3e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  32.3 
 
 
426 aa  249  5e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1278  glycosyl transferase, group 1  36.54 
 
 
408 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1295  glycosyl transferase, group 1  36.54 
 
 
408 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675113  normal  0.124079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1307  glycosyl transferase, group 1  36.3 
 
 
408 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  35.5 
 
 
477 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  33.82 
 
 
427 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  34.6 
 
 
407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  34.81 
 
 
428 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  34.43 
 
 
450 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  32.12 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  34.71 
 
 
418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  31.6 
 
 
443 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  34.22 
 
 
466 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
448 aa  210  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
434 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  33.02 
 
 
424 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 
439 aa  206  9e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.67 
 
 
435 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  32.69 
 
 
448 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  33.17 
 
 
417 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 
393 aa  203  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
435 aa  202  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 
435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 
482 aa  199  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  32.35 
 
 
458 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  32.68 
 
 
480 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 
439 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 
439 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  33.06 
 
 
417 aa  195  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  31.08 
 
 
434 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.34 
 
 
431 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  30.96 
 
 
438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  31.78 
 
 
431 aa  189  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4336  UDP-N-acetylglucosamine  31.76 
 
 
429 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 
458 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
448 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  31.71 
 
 
411 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
450 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
405 aa  173  5e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  29.41 
 
 
420 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  30.02 
 
 
442 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  29.53 
 
 
443 aa  170  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  30.39 
 
 
392 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
421 aa  167  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
400 aa  166  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1891  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120755  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3722  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
400 aa  161  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  29.5 
 
 
413 aa  150  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5208  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
425 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  normal  0.673241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  26.89 
 
 
413 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 
413 aa  144  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>