More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0898 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  783    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  57.62 
 
 
420 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  50.66 
 
 
403 aa  347  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  50.62 
 
 
406 aa  345  8e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  52.55 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1278  glycosyl transferase, group 1  51.7 
 
 
408 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1295  glycosyl transferase, group 1  51.7 
 
 
408 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675113  normal  0.124079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1307  glycosyl transferase, group 1  52.23 
 
 
408 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  51.57 
 
 
405 aa  316  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  49.51 
 
 
418 aa  315  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  46.82 
 
 
422 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  47.63 
 
 
415 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  51.25 
 
 
406 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  47.52 
 
 
402 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  40.05 
 
 
392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  47.22 
 
 
393 aa  262  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1891  glycosyl transferase group 1  43.48 
 
 
415 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120755  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1891  glycosyl transferase group 1  47.7 
 
 
382 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1513  group 1 glycosyl transferase  43.14 
 
 
349 aa  239  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42388  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.15 
 
 
443 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.15 
 
 
498 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.15 
 
 
443 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.95 
 
 
499 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.95 
 
 
495 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.95 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  37.47 
 
 
413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.95 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3722  glycosyl transferase, group 1  41.16 
 
 
400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  41.42 
 
 
400 aa  233  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
440 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  40.45 
 
 
439 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  39.16 
 
 
438 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  40.45 
 
 
439 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  40.45 
 
 
439 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  40.55 
 
 
438 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  40.55 
 
 
438 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
419 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
422 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  35.34 
 
 
672 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  36.43 
 
 
442 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
453 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  37.25 
 
 
430 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5208  glycosyl transferase group 1  36.78 
 
 
425 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  normal  0.673241 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
434 aa  208  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2803  glycosyl transferase group 1  40.1 
 
 
387 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129737  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 
435 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  34.58 
 
 
423 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
424 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
426 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  32.23 
 
 
650 aa  192  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 
425 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 
426 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.81 
 
 
423 aa  186  7e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 
421 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 
421 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.81 
 
 
405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  29.59 
 
 
426 aa  173  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  36.34 
 
 
420 aa  173  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  34.26 
 
 
477 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
405 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3449  glycosyl transferase, group 1  36.34 
 
 
409 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.455826  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
405 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  35.24 
 
 
427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3205  glycosyl transferase, group 1  34.53 
 
 
381 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
419 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  37.7 
 
 
417 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  33.99 
 
 
424 aa  157  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 
482 aa  156  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  35.85 
 
 
411 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  34.14 
 
 
434 aa  154  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  33.73 
 
 
466 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  35.83 
 
 
417 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  34.67 
 
 
448 aa  149  7e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 
442 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  34.39 
 
 
438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 
448 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  34.24 
 
 
450 aa  146  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  33.98 
 
 
428 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  34.89 
 
 
450 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
435 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  33.66 
 
 
480 aa  144  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  34.95 
 
 
435 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  33.17 
 
 
434 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 
405 aa  137  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  33.83 
 
 
439 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  33.26 
 
 
443 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  33.9 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  33.83 
 
 
439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  33.83 
 
 
439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  31.41 
 
 
443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.27 
 
 
435 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
448 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  32.05 
 
 
431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  31.82 
 
 
420 aa  126  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 
458 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  34.26 
 
 
458 aa  123  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4336  UDP-N-acetylglucosamine  30.94 
 
 
429 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>