More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1891 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1891  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 382 aa  724    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  49.38 
 
 		 403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  51.68 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  48.83 
 
 		 406 aa  275  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  47.79 
 
 		 407 aa  263  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  48.06 
 
 		 418 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  43.01 
 
 		 392 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2803  glycosyl transferase group 1  45.17 
 
 		 387 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129737  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  44.95 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  47.73 
 
 		 397 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  45.78 
 
 		 405 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  45.34 
 
 		 406 aa  232  7.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  42.96 
 
 		 415 aa  232  9e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  45.93 
 
 		 420 aa  229  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  41.98 
 
 		 422 aa  229  7e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  39.55 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3722  glycosyl transferase, group 1  42.11 
 
 		 400 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  41.69 
 
 		 400 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1278  glycosyl transferase, group 1  43.59 
 
 		 408 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1295  glycosyl transferase, group 1  43.59 
 
 		 408 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675113  normal  0.124079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1307  glycosyl transferase, group 1  43.33 
 
 		 408 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1513  group 1 glycosyl transferase  42.86 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.42388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1891  glycosyl transferase group 1  42.75 
 
 		 415 aa  210  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120755  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5208  glycosyl transferase group 1  40.36 
 
 		 425 aa  209  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  normal  0.673241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3449  glycosyl transferase, group 1  38.2 
 
 		 409 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.455826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3205  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 		 381 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 		 435 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 		 453 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 422 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 423 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 440 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.93 
 
 		 405 aa  132  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  29.88 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  31.59 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  31.83 
 
 		 437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  31.83 
 
 		 437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 672 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.68 
 
 		 443 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.68 
 
 		 443 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.68 
 
 		 498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.76 
 
 		 495 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.76 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.76 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.76 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  35.03 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 		 425 aa  126  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 430 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 		 405 aa  125  9e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  32.77 
 
 		 420 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 477 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 		 391 aa  122  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  30.96 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  27.87 
 
 		 650 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  34.43 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 		 398 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 391 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 		 360 aa  119  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 412 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  27.89 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  31.65 
 
 		 414 aa  117  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 426 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  31.96 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  31.44 
 
 		 438 aa  114  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 		 421 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  29.62 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.56 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  31.93 
 
 		 443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 		 435 aa  111  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 		 482 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  32.11 
 
 		 427 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 		 410 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  31.97 
 
 		 466 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 		 450 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  26.29 
 
 		 426 aa  109  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 434 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 536 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>