More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2920 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
435 aa  863    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  61.47 
 
 
425 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  60.23 
 
 
410 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  59.53 
 
 
414 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  60.47 
 
 
412 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  60.47 
 
 
412 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  60.47 
 
 
412 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  59.44 
 
 
410 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  55.19 
 
 
417 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  50.47 
 
 
417 aa  364  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  42.93 
 
 
414 aa  286  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  41.03 
 
 
464 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  40.15 
 
 
438 aa  259  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
419 aa  226  7e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 
387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  36.12 
 
 
446 aa  216  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  36.45 
 
 
413 aa  216  9e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 
396 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  34.14 
 
 
408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  34.2 
 
 
935 aa  210  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
536 aa  209  6e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 
410 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 
417 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
395 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
415 aa  202  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  34.47 
 
 
414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  33.56 
 
 
414 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  38.1 
 
 
353 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 
399 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
396 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
396 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
391 aa  192  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 
395 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
396 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 
390 aa  179  8e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
391 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
395 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  35.44 
 
 
402 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
398 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  29.98 
 
 
391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
396 aa  169  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  30.65 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  31.04 
 
 
394 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
407 aa  136  8e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  25.11 
 
 
429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  30.93 
 
 
406 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
379 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.97 
 
 
388 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
413 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  27.99 
 
 
406 aa  127  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
379 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  36.39 
 
 
404 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  29.98 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  26.45 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
390 aa  119  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.59 
 
 
420 aa  119  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  29.79 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
422 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 
420 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  27.94 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  23.54 
 
 
395 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
435 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
379 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
507 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  30.48 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 
360 aa  113  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 
537 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  29.5 
 
 
404 aa  112  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  23.32 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
408 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
408 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
408 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 
402 aa  110  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
421 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
405 aa  109  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  24.19 
 
 
393 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
423 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
419 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
453 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
380 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
426 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  23.93 
 
 
392 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
396 aa  107  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
420 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
351 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 
415 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 
374 aa  106  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
426 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
434 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
430 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
355 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>