More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1298 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
374 aa  735    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  49.6 
 
 
377 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  49.6 
 
 
377 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  51.47 
 
 
377 aa  363  3e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  48.92 
 
 
378 aa  353  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  50.8 
 
 
385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  48.77 
 
 
377 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  45.65 
 
 
382 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  47.73 
 
 
385 aa  350  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  45.65 
 
 
382 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  47.59 
 
 
376 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  45.97 
 
 
382 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  47.87 
 
 
382 aa  345  1e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  44.65 
 
 
377 aa  345  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  45.48 
 
 
377 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  48.12 
 
 
381 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  46.3 
 
 
381 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  43.35 
 
 
377 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  47.86 
 
 
377 aa  329  6e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  43.09 
 
 
377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  43.28 
 
 
373 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  47.86 
 
 
381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  47.33 
 
 
381 aa  300  4e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  43.05 
 
 
387 aa  265  5.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  43.05 
 
 
387 aa  265  8e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  45.97 
 
 
372 aa  262  6e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  39.5 
 
 
507 aa  246  4e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.2 
 
 
380 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.2 
 
 
380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  34.56 
 
 
383 aa  243  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.67 
 
 
380 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 
380 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 
380 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.93 
 
 
380 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.4 
 
 
380 aa  239  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  35.46 
 
 
381 aa  239  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.67 
 
 
380 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  34.67 
 
 
380 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  39.26 
 
 
385 aa  232  9e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  39.1 
 
 
381 aa  232  9e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  41.1 
 
 
420 aa  222  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  40.21 
 
 
375 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  41.22 
 
 
373 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  37.53 
 
 
387 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1095  glycosyl transferase group 1  39.95 
 
 
383 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  39.68 
 
 
375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43286  predicted protein  37.03 
 
 
456 aa  216  7e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  normal  0.0628635 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43238  predicted protein  37.03 
 
 
456 aa  216  7e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169779  normal  0.020707 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  38.65 
 
 
384 aa  213  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.89 
 
 
373 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  39.15 
 
 
378 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  39.1 
 
 
426 aa  209  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0755  glycosyl transferase, group 1  40.26 
 
 
375 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0761  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
376 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0775  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
376 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193821  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  36.99 
 
 
434 aa  206  7e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 
416 aa  205  8e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  37.5 
 
 
405 aa  202  9e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  40.11 
 
 
378 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  39.52 
 
 
427 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2239  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 
458 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
381 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07870  glycosyltransferase  37.98 
 
 
391 aa  196  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 
387 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  37.53 
 
 
393 aa  195  9e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
387 aa  193  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  35.56 
 
 
432 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  36.44 
 
 
393 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  36.63 
 
 
373 aa  186  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 
390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
405 aa  184  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 
406 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.06 
 
 
403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 
413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  30 
 
 
376 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  39.05 
 
 
382 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  33.85 
 
 
377 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  35.37 
 
 
406 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  36.01 
 
 
819 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  35.37 
 
 
406 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  34.85 
 
 
403 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 
812 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
393 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 
396 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  32.89 
 
 
372 aa  175  9e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  35.82 
 
 
389 aa  176  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  33.97 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  40.12 
 
 
398 aa  172  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
379 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  37.13 
 
 
390 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  37.13 
 
 
390 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  35.01 
 
 
396 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
398 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  34.56 
 
 
820 aa  170  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 
406 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.75 
 
 
396 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  35.83 
 
 
816 aa  169  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
743 aa  169  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  38.99 
 
 
408 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>