More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2239 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2239  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
458 aa  890    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1907  glycosyl transferase, group 1  80.27 
 
 
426 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  51.85 
 
 
420 aa  356  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  53.32 
 
 
427 aa  355  6.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  52.15 
 
 
378 aa  334  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  50.27 
 
 
393 aa  326  7e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  47.12 
 
 
434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  50 
 
 
405 aa  318  1e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 
375 aa  317  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1160  glycosyl transferase group 1  47.76 
 
 
385 aa  317  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000209348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  49.19 
 
 
375 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0220  glycosyl transferase group 1  50.94 
 
 
373 aa  307  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  48.81 
 
 
384 aa  305  9.000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07870  glycosyltransferase  46.34 
 
 
391 aa  298  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0993  glycosyl transferase group 1  52.69 
 
 
382 aa  296  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0761  glycosyl transferase, group 1  49.46 
 
 
376 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0775  glycosyl transferase, group 1  49.46 
 
 
376 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193821  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0755  glycosyl transferase, group 1  49.19 
 
 
375 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1095  glycosyl transferase group 1  49.6 
 
 
383 aa  294  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  43.58 
 
 
381 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  43.32 
 
 
381 aa  289  8e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  47.43 
 
 
381 aa  289  8e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  44.32 
 
 
377 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  35.7 
 
 
381 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 
376 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  33.33 
 
 
382 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  33.33 
 
 
382 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  33.33 
 
 
382 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  36.08 
 
 
381 aa  223  8e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  31.84 
 
 
377 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  31.58 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  32.11 
 
 
377 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  35.64 
 
 
382 aa  219  8.999999999999998e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  32.18 
 
 
373 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 
378 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
385 aa  216  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 
377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 
377 aa  216  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 
377 aa  215  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
377 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  36.12 
 
 
387 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  33.59 
 
 
385 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  35.85 
 
 
387 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  34.84 
 
 
377 aa  204  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  39.15 
 
 
374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.63 
 
 
380 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
381 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.87 
 
 
380 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.84 
 
 
380 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  28.84 
 
 
380 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
380 aa  186  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.84 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  35.6 
 
 
416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
380 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
380 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.31 
 
 
380 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  30.42 
 
 
372 aa  182  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
383 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
403 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  32.58 
 
 
406 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
378 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.42 
 
 
373 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 
406 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
379 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
655 aa  172  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43286  predicted protein  33.96 
 
 
456 aa  171  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  normal  0.0628635 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43238  predicted protein  33.96 
 
 
456 aa  171  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169779  normal  0.020707 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
387 aa  167  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  31.62 
 
 
393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1670  glycosyl transferase  27.3 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 
396 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 
400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
378 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
406 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 
403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.93 
 
 
403 aa  163  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
396 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.99 
 
 
396 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  33.41 
 
 
413 aa  161  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3550  glycosyl transferase, group 1  39.04 
 
 
389 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
432 aa  160  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 
406 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 
373 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 
390 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
381 aa  157  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 
390 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26870  glycosyltransferase  33.69 
 
 
372 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.730653  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 
507 aa  153  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 
416 aa  152  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
393 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  34.28 
 
 
378 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  34.06 
 
 
381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3802  glycosyl transferase, group 1  34.73 
 
 
394 aa  146  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.769025  normal  0.0224743 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
398 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
408 aa  143  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 
772 aa  137  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 
385 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>