More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3774 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3886  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 390 aa  775    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3774  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 390 aa  775    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.872783  normal  0.105154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  62.01 
 
 		 413 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  52.51 
 
 		 416 aa  348  7e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2734  glycosyl transferase, group 1  49.22 
 
 		 403 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  50.26 
 
 		 381 aa  336  2.9999999999999997e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1801  glycosyl transferase group 1  52.66 
 
 		 408 aa  332  9e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  49.74 
 
 		 378 aa  330  4e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  48.39 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3543  glycosyl transferase, group 1  50.82 
 
 		 373 aa  326  5e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4678  putative glycosyl transferase  47.85 
 
 		 406 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  47.85 
 
 		 406 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  47.83 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53380  putative glycosyl transferase  47.58 
 
 		 406 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  49.73 
 
 		 396 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  47.21 
 
 		 403 aa  322  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.73 
 
 		 396 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0885  glycosyl transferase, group 1  48.53 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2328  glycosyl transferase, group 1  45.36 
 
 		 432 aa  316  5e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  47.92 
 
 		 404 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.51 
 
 		 403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  46.12 
 
 		 405 aa  311  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2540  glycosyl transferase group 1  51.47 
 
 		 398 aa  310  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  45.36 
 
 		 385 aa  294  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  41.34 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  42.93 
 
 		 655 aa  280  4e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1425  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.7 
 
 		 373 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1142  glycosyl transferase group 1  42.7 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.696085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2305  glycosyltransferase  40.16 
 
 		 393 aa  236  6e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  38.65 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  38.92 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  38.11 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.89 
 
 		 380 aa  202  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0705  glycosyl transferase group 1  38.25 
 
 		 345 aa  202  9e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.240471 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 		 376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.39 
 
 		 380 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 		 380 aa  199  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4513  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.16 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4907  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.89 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957632  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  40.4 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.87 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4872  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.87 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  29.87 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1734  glycosyl transferase, group 1  37.53 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00199355  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  36.44 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3604  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 		 387 aa  193  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.592965  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0397  glycosyl transferase, group 1  38.08 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.992646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 		 377 aa  186  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0266  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 		 363 aa  186  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  31.17 
 
 		 377 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3283  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0978  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1080  hypothetical protein  35.6 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.324982 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0731  glycosyl transferase group 1  36.27 
 
 		 384 aa  180  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0636  glycosyl transferase, group 1  36.17 
 
 		 350 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0666764  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  30.89 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0584  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2115  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0564866  normal  0.0238358 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  30.89 
 
 		 382 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2843  glycosyl transferase group 1  36.69 
 
 		 393 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10567  mannosyltransferase pimB  36.97 
 
 		 378 aa  176  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.711868  normal  0.156574 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0695  glycosyl transferase, group 1  38.32 
 
 		 367 aa  176  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3672  glycosyl transferase group 1  39.75 
 
 		 348 aa  176  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.745168 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  34.44 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  34.24 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1631  glycosyl transferase, group 1  38.06 
 
 		 352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  32.79 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  30.08 
 
 		 382 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1337  glycosyl transferase group 1  40.65 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.976038  normal  0.352986 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1446  glycosyl transferase, group 1  37.95 
 
 		 349 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.131032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  34.66 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  37.58 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5260  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1070  glycosyl transferase, group 1  33.68 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2485  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  32.05 
 
 		 385 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 		 816 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 772 aa  171  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  30.08 
 
 		 377 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1622  glycosyl transferase, group 1  38.28 
 
 		 352 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  29.81 
 
 		 377 aa  170  5e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1822  glycosyl transferase, group 1  36.49 
 
 		 345 aa  169  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179572  normal  0.795159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3112  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.833394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  31.91 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6212  putative glycosyl transferase (group 1)  38.06 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04450  glycosyltransferase  32.63 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22600  putative glycosyl transferase  36.31 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.809409  hitchhiker  0.000260588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32760  Glycosyl transferase, group 1 protein  36.77 
 
 		 353 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 381 aa  166  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>